RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227520.9

CCDC86-201, Transcript of coiled-coil domain containing 86, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC86, Length 1,893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC86-201ENST00000227520 C2orf54Q08AI8 447 aa15.52■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 EDRF1Q3B7T1 1238 aa15.52■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 PRR16Q569H4 304 aa15.52■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 HAUS3Q68CZ6 603 aa15.52■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 POTEGQ6S5H5 508 aa15.52■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa15.52■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa15.52■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 MMGT1Q8N4V1 131 aa15.52■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 RMDN3Q96TC7 470 aa15.52■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 FAM184BQ9ULE4 1060 aa15.52■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa15.51■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 TCP1P17987 556 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa15.51■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 CATSPER3Q86XQ3 398 aa15.51■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 ERMNQ8TAM6 284 aa15.51■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 FAM71BQ8TC56 605 aa15.51■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 COG1Q8WTW3 980 aa15.51■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 DRC1Q96MC2 740 aa15.51■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 EHMT1Q9H9B1 1298 aa15.51■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 PXMP2Q9NR77 195 aa15.51■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 PDGFCQ9NRA1 345 aa15.51■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 VPS18Q9P253 973 aa15.51■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 SALL4Q9UJQ4 1053 aa15.51■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 HYOU1Q9Y4L1 999 aa15.51■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa15.5■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 RPA1P27694 616 aa15.5■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 SREBF1P36956 1147 aa15.5■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 ADAM9Q13443 819 aa15.5■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 GIT2Q14161 759 aa15.5■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 TAPT1Q6NXT6 567 aa15.5■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 SAMD3Q8N6K7 520 aa15.5■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 LENG9Q96B70 501 aa15.5■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 FAM20AQ96MK3 541 aa15.5■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 OSBPL9Q96SU4 736 aa15.5■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa15.5■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 DNM3Q9UQ16 869 aa15.5■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 FAN1Q9Y2M0 1017 aa15.5■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 STK24Q9Y6E0 443 aa15.5■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 MYH10P35580 1976 aa15.5■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 CETN3O15182 167 aa15.5■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 RARBP10826 455 aa15.5■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 ADCYAP1R1P41586 468 aa15.5■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 PSMC6P62333 389 aa15.5■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 HSP90B2PQ58FF3 399 aa15.5■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 TMEM63BQ5T3F8 832 aa15.5■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 ARHGEF16Q5VV41 709 aa15.5■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 CCDC70Q6NSX1 233 aa15.5■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 ANKLE1Q8NAG6 615 aa15.5■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 IL31RAQ8NI17 732 aa15.5■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 NOX5Q96PH1 765 aa15.5■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 CRACR2AQ9BSW2 395 aa15.5■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 ZHX3Q9H4I2 956 aa15.5■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 VTA1Q9NP79 307 aa15.5■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 MED4Q9NPJ6 270 aa15.5■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 CIITAP33076 1130 aa15.49■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP15.49■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 NFRKBQ6P4R8 1299 aa15.49■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 PDCD2LQ9BRP1 358 aa15.49■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 GANQ9H2C0 597 aa15.49■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa15.49■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 HPCAL4Q9UM19 191 aa15.49■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 FAM86B1E9PN63 330 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 MEIS1O00470 390 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 ZMYND10O75800 440 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 PGK1P00558 417 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 FAM86B2P0C5J1 330 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 CASP5P51878 434 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 APBA1Q02410 837 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 SPATA4Q8NEY3 305 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 RUBCNQ92622 972 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 TLR10Q9BXR5 811 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 AIPL1Q9NZN9 384 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 FRMPD4Q14CM0 1322 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 NCK2O43639 380 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 CYP3A4P08684 503 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 SMPD1P17405 629 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 CAPN2P17655 700 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 NR2F2P24468 414 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 HOXD13P35453 343 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 ZNF76P36508 570 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 LMAN1P49257 510 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC86-201ENST00000227520 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms