RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219473.11

USP10-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP10, Length 3,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP10-201ENST00000219473 FAM153AQ9UHL3 310 aa16.2■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 AGPSO00116 658 aa16.2■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 RAD51CO43502 376 aa16.2■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 XXYLT1Q8NBI6 393 aa16.2■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 SLC35G2Q8TBE7 412 aa16.2■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 PLEKHO2Q8TD55 490 aa16.2■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 STRA6Q9BX79 667 aa16.2■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 TMEM206Q9H813 350 aa16.2■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 CCDC66A2RUB6 948 aa16.19■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 WDR64B1ANS9 1081 aa16.19■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 PEX10O60683 326 aa16.19■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 PSMC5P62195 406 aa16.19■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 NLRX1Q86UT6 975 aa16.19■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 CBWD2Q8IUF1 395 aa16.19■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 TEX2Q8IWB9 1127 aa16.19■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 PICK1Q9NRD5 415 aa16.19■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 KIF13BQ9NQT8 1826 aa16.19■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 NR3C2P08235 984 aa16.19■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 EPHB4P54760 987 aa16.19■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP16.19■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 NFIL3Q16649 462 aa16.19■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 IFT20Q8IY31 132 aa16.19■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 ARHGEF26Q96DR7 871 aa16.19■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 THAP2Q9H0W7 228 aa16.19■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 VPS33BQ9H267 617 aa16.19■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 GABBR1Q9UBS5 961 aa16.19■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 RNF14Q9UBS8 474 aa16.19■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 USP20Q9Y2K6 914 aa16.19■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 ANKRD63C9JTQ0 380 aa16.19■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 BACE1P56817 501 aa16.19■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 PPM1KQ8N3J5 372 aa16.19■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 CEP170P1Q96L14 293 aa16.19■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 PCNTO95613 3336 aa16.18■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa16.18■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 ADRB2P07550 413 aa16.18■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 LMNB1P20700 586 aa16.18■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 CETN1Q12798 172 aa16.18■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 ANO5Q75V66 913 aa16.18■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 RUFY1Q96T51 708 aa16.18■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 ITGA4P13612 1032 aa16.18■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP16.18■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 NIPA1Q7RTP0 329 aa16.18■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP16.18■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 LMO3Q8TAP4 145 aa16.18■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 AFAP1L1Q8TED9 768 aa16.18■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 DENND3A2RUS2 1198 aa16.17■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 MXI1P50539 228 aa16.17■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 TNNC1P63316 161 aa16.17■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 ZSCAN26Q16670 478 aa16.17■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 SWSAP1Q6NVH7 229 aa16.17■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 DLK2Q6UY11 383 aa16.17■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 SLC9A9Q8IVB4 645 aa16.17■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 ZNF280CQ8ND82 737 aa16.17■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 SLC30A5Q8TAD4 765 aa16.17■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa16.17■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 BTNL10A8MVZ5 291 aa16.17■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 KRIT1O00522 736 aa16.17■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 NPTX2P47972 431 aa16.17■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 PPARDQ03181 441 aa16.17■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 C4orf19Q8IY42 314 aa16.17■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 OLIG1Q8TAK6 271 aa16.17■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 SLC16A10Q8TF71 515 aa16.17■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 LMBR1Q8WVP7 490 aa16.17■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 DLATP10515 647 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 PTPRAP18433 802 aa16.16■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 TGFB2P61812 414 aa16.16■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 C1orf220Q5T0J3 134 aa16.16■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 BSNDQ8WZ55 320 aa16.16■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 TMEM117Q9H0C3 514 aa16.16■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 AMFRQ9UKV5 643 aa16.16■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 NENFQ9UMX5 172 aa16.16■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa16.16■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 GOLGA6CA6NDK9 693 aa16.16■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 GOLGA6DP0CG33 693 aa16.16■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 ADSSP30520 456 aa16.16■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 COPB2P35606 906 aa16.16■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 JAK3P52333 1124 aa16.16■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 KRT76Q01546 638 aa16.16■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 NT5DC3Q86UY8 548 aa16.16■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 SCYL3Q8IZE3 742 aa16.16■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 RABEP2Q9H5N1 569 aa16.16■□□□□ 0.18
USP10-201ENST00000219473 KMT5AQ9NQR1 393 aa16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms