RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000185355.6

Ldb1-208, Transcript of LIM domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ldb1, Length 2,088 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Cpsf2O35218 782 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Sox10Q04888 466 aa30.1■■■□□ 2.41
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Tatdn3Q3U1C6 294 aa30.1■■■□□ 2.41
Ldb1-208ENSMUST00000185355 BC051142Q3V0M8 400 aa30.1■■■□□ 2.41
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Cnot7Q60809 285 aa30.1■■■□□ 2.41
Ldb1-208ENSMUST00000185355 HrQ61645 1182 aa30.1■■■□□ 2.41
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Fhod1Q6P9Q4 1197 aa30.1■■■□□ 2.41
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Micall1Q8BGT6 870 aa30.1■■■□□ 2.41
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Nxnl2Q9D531 156 aa30.1■■■□□ 2.41
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Golga5Q9QYE6 729 aa30.1■■■□□ 2.41
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Mettl1Q9Z120 268 aa30.1■■■□□ 2.41
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Scn10aQ6QIY3 1958 aa30.09■■■□□ 2.41
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Mdm4O35618 489 aa30.09■■■□□ 2.41
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Tas2r134Q7TQB0 298 aa30.09■■■□□ 2.41
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Ublcp1Q8BGR9 318 aa30.09■■■□□ 2.41
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Klhl7Q8BUL5 586 aa30.09■■■□□ 2.41
Ldb1-208ENSMUST00000185355 IvdQ9JHI5 424 aa30.09■■■□□ 2.41
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Astn1Q61137 1302 aa30.09■■■□□ 2.41
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Unc13dB2RUP2 1085 aa30.08■■■□□ 2.41
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Zfp266E9Q2S7 604 aa30.08■■■□□ 2.41
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Cd70O55237 195 aa30.08■■■□□ 2.41
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Bcat1P24288 386 aa30.08■■■□□ 2.41
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Ano5Q75UR0 904 aa30.08■■■□□ 2.41
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Ints2Q80UK8 1198 aa30.08■■■□□ 2.41
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Trim65Q8BFW4 522 aa30.08■■■□□ 2.41
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Eps8l2Q99K30 729 aa30.08■■■□□ 2.41
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Fut8Q9WTS2 575 aa30.08■■■□□ 2.41
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Zrsr2Q62377 462 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Cfap100Q80VN0 613 aa30.08■■■□□ 2.41
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Atp2a1Q8R429 994 aa30.08■■■□□ 2.41
Ldb1-208ENSMUST00000185355 BrdtQ91Y44 956 aa30.08■■■□□ 2.41
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Usp26Q99MX1 835 aa30.08■■■□□ 2.41
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Skor2A7M7C7 1008 aa30.07■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Gm21973F6WEZ7 68 aa30.07■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Mmp10O55123 476 aa30.07■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Axin2O88566 840 aa30.07■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Ttc39dQ0VF76 604 aa30.07■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Dcaf15Q6PFH3 600 aa30.07■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Slc26a6Q8CIW6 758 aa30.07■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Gdap1l1Q8VE33 370 aa30.07■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Nxf1Q99JX7 618 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Znf354bQ9QXT9 601 aa30.07■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Ankrd2Q9WV06 328 aa30.07■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 SisF8VQM5 1818 aa30.07■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Brca1P48754 1812 aa30.07■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Zc3h15Q3TIV5 426 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Sh3gl2Q62420 352 aa30.07■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Kcnk18Q6VV64 394 aa30.07■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Pgm5Q8BZF8 567 aa30.07■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 P3h4Q8K2B0 443 aa30.07■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Trmt10bQ9D075 318 aa30.07■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 IscuQ9D7P6 168 aa30.07■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 FibpQ9JI19 357 aa30.07■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Sbno2Q7TNB8 1349 aa30.06■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Rnpc3Q3UZ01 514 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Trim37Q6PCX9 961 aa30.06■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Cnga3Q9JJZ8 631 aa30.06■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Sept3Q9Z1S5 350 aa30.06■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 RptorQ8K4Q0 1335 aa30.05■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Osbpl9A2A8Z1 736 aa30.05■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 AunipE9Q6Z5 340 aa30.05■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Akr1b10G5E895 316 aa30.05■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Mucl2P02815 138 aa30.05■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 ProcP33587 460 aa30.05■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Adamts10P58459 1104 aa30.05■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Cd37Q61470 281 aa30.05■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 E2f5Q61502 335 aa30.05■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Pja2Q80U04 707 aa30.05■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Ccdc169Q8BXX9 214 aa30.05■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Rhobtb2Q91V93 728 aa30.05■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 JmyQ9QXM1 983 aa30.05■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Sec24cG3X972 1096 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Gm6121L7MUF1 212 aa30.05■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Hoxc10P31257 342 aa30.05■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Map2k1P31938 393 aa30.05■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Mfsd14aP70187 490 aa30.05■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Myo1fP70248 1099 aa30.05■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Pla2g4cQ64GA5 597 aa30.05■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Dync1li2Q6PDL0 492 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Srrm3Q80WV7 648 aa30.05■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Rufy1Q8BIJ7 712 aa30.05■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Hook3Q8BUK6 718 aa30.05■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Ttc22Q8C159 568 aa30.05■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Fbxo43Q8CDI2 640 aa30.05■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Klhl11Q8CE33 709 aa30.05■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 OscarQ8VBT3 265 aa30.05■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Nmrk1Q91W63 195 aa30.05■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Il21rQ9JHX3 529 aa30.05■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Magea5O89009 320 aa30.04■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Magea8O89012 320 aa30.04■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 PrkceP16054 737 aa30.04■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Ap1m1P35585 423 aa30.04■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Acsbg2Q2XU92 667 aa30.04■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Adamts18Q4VC17 1219 aa30.04■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Magea3Q6T340 320 aa30.04■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Tcp10aQ80W76 438 aa30.04■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Rusc1Q8BG26 893 aa30.04■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Acsl3Q9CZW4 720 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Actr2P61161 394 aa30.03■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Taf1bP97358 586 aa30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31 ms