RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)M

tW(CCA)M, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)M, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)MtW(CCA)M ULA1Q12059 462 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M WTM1Q12363 437 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M HMS1Q12398 434 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M AIR2Q12476 344 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M MHF2Q3E829 80 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M YBL113CQ7M4S9 792 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M TSC13Q99190 310 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M DET1Q99288 334 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M RAD7P06779 565 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M NFT1P0CE68 1218 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M YOL163WP0CF20 169 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M SEC12P11655 471 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M UGA1P17649 471 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M PRP28P23394 588 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M CDC10P25342 322 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M SED4P25365 1065 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M ATP7P30902 174 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M PUP2P32379 260 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M CDC3P32457 520 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M GPX1P36014 167 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M PDX3P38075 228 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M AIM3P38266 947 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M TSL1P38427 1098 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M ECM14P38836 430 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M RCY1P39531 840 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M ISC1P40015 477 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M MRX1P40050 688 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M YIL029CP40538 142 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M NAS2P40555 220 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M IAH1P41734 238 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M MRK1P50873 501 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M GET1P53192 235 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M RBG2P53295 368 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M CRZ1P53968 678 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M ASI1P54074 624 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M UGO1Q03327 502 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M ACL4Q03771 387 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M SNO4Q04902 237 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M UTP21Q06078 939 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M YPR147CQ06522 304 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M NDL1Q06568 189 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M IPK1Q06667 281 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M SYO1Q07395 620 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M RRT8Q08219 342 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M HSP33Q08914 237 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M HSP32Q08992 237 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M RTC5Q12108 567 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M SPC3Q12133 184 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M WSC3Q12215 556 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M YLR126CQ12288 251 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M SFM1Q12314 213 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M DBP10Q12389 995 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M MRX4Q12467 430 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M YOR343CQ12484 108 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M YDL007C-AQ2V2Q0 85 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M MHF1Q3E835 90 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M YHR214C-EQ8TGK0 99 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M GLT1Q12680 2145 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M CDC39P25655 2108 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M SIR3P06701 978 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M PEP4P07267 405 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M CAR2P07991 424 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M YOL162WP0CF19 215 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M NUP1P20676 1076 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M CMK2P22517 447 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M EXG1P23776 448 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M PCL1P24867 279 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M DAL80P26343 269 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M PPA2P28239 310 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M IDH1P28834 360 aaKnown RBP RIP-Chip data2.29□□□□□ -2.04not detected
tW(CCA)MtW(CCA)M VPH2P32341 215 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M MDH3P32419 343 aaKnown RBP RIP-Chip data2.29□□□□□ -2.04not detected
tW(CCA)MtW(CCA)M PPG1P32838 368 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M JEN1P36035 616 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M YBR063CP38083 404 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M SRO77P38163 1010 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M RBG1P39729 369 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M YER084WP40057 128 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M YER121WP40076 114 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M MPM1P40364 252 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M AIR1P40507 360 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M MAM33P40513 266 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M VHR1P40522 640 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M GDS1P41913 522 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M NOP9P47077 666 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M BAT2P47176 376 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M SAM37P50110 327 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M SIP18P50263 79 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M UBC13P52490 153 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M MTM1P53320 366 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M COS1P53822 381 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M MRPL19P53875 158 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M IGO1P53897 168 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M SPR6Q01684 191 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M RPL6AQ02326 176 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M DML1Q03652 475 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M API2Q04413 109 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M SPC2Q04969 178 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M ARO10Q06408 635 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M RRP15Q06511 250 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
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