RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)K

tW(CCA)K, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)K, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)KtW(CCA)K ULA1Q12059 462 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K WTM1Q12363 437 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K HMS1Q12398 434 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K AIR2Q12476 344 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K MHF2Q3E829 80 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K YBL113CQ7M4S9 792 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K TSC13Q99190 310 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K DET1Q99288 334 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K RAD7P06779 565 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K NFT1P0CE68 1218 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K YOL163WP0CF20 169 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K SEC12P11655 471 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K UGA1P17649 471 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K PRP28P23394 588 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K CDC10P25342 322 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K SED4P25365 1065 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K ATP7P30902 174 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K PUP2P32379 260 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K CDC3P32457 520 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K GPX1P36014 167 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K PDX3P38075 228 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K AIM3P38266 947 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K TSL1P38427 1098 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K ECM14P38836 430 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K RCY1P39531 840 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K ISC1P40015 477 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K MRX1P40050 688 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K YIL029CP40538 142 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K NAS2P40555 220 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K IAH1P41734 238 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K MRK1P50873 501 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K GET1P53192 235 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K RBG2P53295 368 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K CRZ1P53968 678 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K ASI1P54074 624 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K UGO1Q03327 502 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K ACL4Q03771 387 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K SNO4Q04902 237 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K UTP21Q06078 939 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K YPR147CQ06522 304 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K NDL1Q06568 189 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K IPK1Q06667 281 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K SYO1Q07395 620 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K RRT8Q08219 342 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K HSP33Q08914 237 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K HSP32Q08992 237 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K RTC5Q12108 567 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K SPC3Q12133 184 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K WSC3Q12215 556 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K YLR126CQ12288 251 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K SFM1Q12314 213 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K DBP10Q12389 995 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K MRX4Q12467 430 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K YOR343CQ12484 108 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K YDL007C-AQ2V2Q0 85 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K MHF1Q3E835 90 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K YHR214C-EQ8TGK0 99 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K GLT1Q12680 2145 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K CDC39P25655 2108 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K SIR3P06701 978 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K PEP4P07267 405 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K CAR2P07991 424 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K YOL162WP0CF19 215 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K NUP1P20676 1076 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K CMK2P22517 447 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K EXG1P23776 448 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K PCL1P24867 279 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K DAL80P26343 269 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K PPA2P28239 310 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K IDH1P28834 360 aaKnown RBP RIP-Chip data2.29□□□□□ -2.04not detected
tW(CCA)KtW(CCA)K VPH2P32341 215 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K MDH3P32419 343 aaKnown RBP RIP-Chip data2.29□□□□□ -2.04not detected
tW(CCA)KtW(CCA)K PPG1P32838 368 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K JEN1P36035 616 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K YBR063CP38083 404 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K SRO77P38163 1010 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K RBG1P39729 369 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K YER084WP40057 128 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K YER121WP40076 114 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K MPM1P40364 252 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K AIR1P40507 360 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K MAM33P40513 266 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K VHR1P40522 640 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K GDS1P41913 522 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K NOP9P47077 666 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K BAT2P47176 376 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K SAM37P50110 327 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K SIP18P50263 79 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K UBC13P52490 153 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K MTM1P53320 366 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K COS1P53822 381 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K MRPL19P53875 158 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K IGO1P53897 168 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K SPR6Q01684 191 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K RPL6AQ02326 176 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K DML1Q03652 475 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K API2Q04413 109 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K SPC2Q04969 178 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K ARO10Q06408 635 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K RRP15Q06511 250 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
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