RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)J

tW(CCA)J, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)J, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)JtW(CCA)J ULA1Q12059 462 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J WTM1Q12363 437 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J HMS1Q12398 434 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J AIR2Q12476 344 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J MHF2Q3E829 80 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J YBL113CQ7M4S9 792 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J TSC13Q99190 310 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J DET1Q99288 334 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J RAD7P06779 565 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J NFT1P0CE68 1218 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J YOL163WP0CF20 169 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J SEC12P11655 471 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J UGA1P17649 471 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J PRP28P23394 588 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J CDC10P25342 322 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J SED4P25365 1065 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J ATP7P30902 174 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J PUP2P32379 260 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J CDC3P32457 520 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J GPX1P36014 167 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J PDX3P38075 228 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J AIM3P38266 947 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J TSL1P38427 1098 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J ECM14P38836 430 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J RCY1P39531 840 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J ISC1P40015 477 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J MRX1P40050 688 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J YIL029CP40538 142 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J NAS2P40555 220 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J IAH1P41734 238 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J MRK1P50873 501 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J GET1P53192 235 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J RBG2P53295 368 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J CRZ1P53968 678 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J ASI1P54074 624 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J UGO1Q03327 502 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J ACL4Q03771 387 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J SNO4Q04902 237 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J UTP21Q06078 939 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J YPR147CQ06522 304 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J NDL1Q06568 189 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J IPK1Q06667 281 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J SYO1Q07395 620 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J RRT8Q08219 342 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J HSP33Q08914 237 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J HSP32Q08992 237 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J RTC5Q12108 567 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J SPC3Q12133 184 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J WSC3Q12215 556 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J YLR126CQ12288 251 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J SFM1Q12314 213 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J DBP10Q12389 995 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J MRX4Q12467 430 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J YOR343CQ12484 108 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J YDL007C-AQ2V2Q0 85 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J MHF1Q3E835 90 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J YHR214C-EQ8TGK0 99 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J GLT1Q12680 2145 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J CDC39P25655 2108 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J SIR3P06701 978 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J PEP4P07267 405 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J CAR2P07991 424 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J YOL162WP0CF19 215 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J NUP1P20676 1076 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J CMK2P22517 447 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J EXG1P23776 448 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J PCL1P24867 279 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J DAL80P26343 269 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J PPA2P28239 310 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J IDH1P28834 360 aaKnown RBP RIP-Chip data2.29□□□□□ -2.04not detected
tW(CCA)JtW(CCA)J VPH2P32341 215 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J MDH3P32419 343 aaKnown RBP RIP-Chip data2.29□□□□□ -2.04not detected
tW(CCA)JtW(CCA)J PPG1P32838 368 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J JEN1P36035 616 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J YBR063CP38083 404 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J SRO77P38163 1010 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J RBG1P39729 369 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J YER084WP40057 128 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J YER121WP40076 114 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J MPM1P40364 252 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J AIR1P40507 360 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J MAM33P40513 266 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J VHR1P40522 640 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J GDS1P41913 522 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J NOP9P47077 666 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J BAT2P47176 376 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J SAM37P50110 327 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J SIP18P50263 79 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J UBC13P52490 153 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J MTM1P53320 366 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J COS1P53822 381 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J MRPL19P53875 158 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J IGO1P53897 168 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J SPR6Q01684 191 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL6AQ02326 176 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J DML1Q03652 475 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J API2Q04413 109 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J SPC2Q04969 178 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J ARO10Q06408 635 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J RRP15Q06511 250 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
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