RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)G2

tW(CCA)G2, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)G2, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 ULA1Q12059 462 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 WTM1Q12363 437 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 HMS1Q12398 434 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 AIR2Q12476 344 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 MHF2Q3E829 80 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YBL113CQ7M4S9 792 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 TSC13Q99190 310 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 DET1Q99288 334 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 RAD7P06779 565 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 NFT1P0CE68 1218 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YOL163WP0CF20 169 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SEC12P11655 471 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 UGA1P17649 471 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 PRP28P23394 588 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 CDC10P25342 322 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SED4P25365 1065 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 ATP7P30902 174 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 PUP2P32379 260 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 CDC3P32457 520 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 GPX1P36014 167 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 PDX3P38075 228 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 AIM3P38266 947 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 TSL1P38427 1098 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 ECM14P38836 430 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 RCY1P39531 840 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 ISC1P40015 477 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 MRX1P40050 688 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YIL029CP40538 142 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 NAS2P40555 220 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 IAH1P41734 238 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 MRK1P50873 501 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 GET1P53192 235 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 RBG2P53295 368 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 CRZ1P53968 678 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 ASI1P54074 624 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 UGO1Q03327 502 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 ACL4Q03771 387 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SNO4Q04902 237 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 UTP21Q06078 939 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YPR147CQ06522 304 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 NDL1Q06568 189 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 IPK1Q06667 281 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SYO1Q07395 620 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 RRT8Q08219 342 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 HSP33Q08914 237 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 HSP32Q08992 237 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 RTC5Q12108 567 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SPC3Q12133 184 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 WSC3Q12215 556 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YLR126CQ12288 251 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SFM1Q12314 213 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 DBP10Q12389 995 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 MRX4Q12467 430 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YOR343CQ12484 108 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YDL007C-AQ2V2Q0 85 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 MHF1Q3E835 90 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YHR214C-EQ8TGK0 99 aa2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 GLT1Q12680 2145 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 CDC39P25655 2108 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SIR3P06701 978 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 PEP4P07267 405 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 CAR2P07991 424 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YOL162WP0CF19 215 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 NUP1P20676 1076 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 CMK2P22517 447 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 EXG1P23776 448 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 PCL1P24867 279 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 DAL80P26343 269 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 PPA2P28239 310 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 IDH1P28834 360 aaKnown RBP RIP-Chip data2.29□□□□□ -2.04not detected
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 VPH2P32341 215 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 MDH3P32419 343 aaKnown RBP RIP-Chip data2.29□□□□□ -2.04not detected
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 PPG1P32838 368 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 JEN1P36035 616 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YBR063CP38083 404 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SRO77P38163 1010 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 RBG1P39729 369 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YER084WP40057 128 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YER121WP40076 114 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 MPM1P40364 252 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 AIR1P40507 360 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 MAM33P40513 266 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 VHR1P40522 640 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 GDS1P41913 522 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 NOP9P47077 666 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 BAT2P47176 376 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SAM37P50110 327 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SIP18P50263 79 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 UBC13P52490 153 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 MTM1P53320 366 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 COS1P53822 381 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 MRPL19P53875 158 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 IGO1P53897 168 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SPR6Q01684 191 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 RPL6AQ02326 176 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 DML1Q03652 475 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 API2Q04413 109 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SPC2Q04969 178 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 ARO10Q06408 635 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 RRP15Q06511 250 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
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