RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeastyeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP4YPR178W DPM1P14020 267 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W ERD1P16151 362 aa9.58□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W RFA2P26754 273 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W NAM9P27929 486 aa9.58□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W ISF1P32488 338 aa9.58□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W PAU2P32612 120 aa9.58□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W ISC10P32645 267 aa9.58□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W CDC13P32797 924 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W VPS17P32913 551 aa9.58□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W ECT1P33412 323 aa9.58□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W CAT5P41735 233 aa9.58□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W PPT1P53043 513 aa9.58□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W YGL101WP53144 215 aa9.58□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W YNR021WP53723 404 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W MSC1Q03104 513 aa9.58□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W SSY1Q03770 852 aa9.58□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W KEI1Q06346 221 aa9.58□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W CDA2Q06703 312 aa9.58□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W BTS1Q12051 335 aa9.58□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W ARC19P33204 171 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W MTH1P35198 433 aa9.57□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W SRY1P36007 326 aa9.57□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W LAG1P38703 411 aa9.57□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W YEL068CP39977 110 aa9.57□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W MAD2P40958 196 aa9.57□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W UBC9P50623 157 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W CGR1P53188 120 aa9.57□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W SNX41Q04053 625 aa9.57□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W HLR1Q04429 423 aa9.57□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W YMR252CQ04814 134 aa9.57□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W YMR310CQ04867 317 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W FSH3Q99369 266 aa9.57□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W LDS1P31379 325 aa9.56□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W ATS1P31386 333 aa9.56□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W PPG1P32838 368 aa9.56□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W POA1P38218 177 aa9.56□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W TCM62P38228 572 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W BMT5P40493 336 aa9.56□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W UTP25P40498 721 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W YFR020WP43600 232 aa9.56□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W TAD2P47058 250 aa9.56□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W PHB2P50085 310 aa9.56□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W COS12P53053 380 aa9.56□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W ASI3P53983 676 aa9.56□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W YKR011CQ02209 353 aa9.56□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W ANT1Q06497 328 aa9.56□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W MRP1P10662 321 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W ARO3P14843 370 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W YSR3P23501 404 aa9.55□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W MRP17P28778 131 aa9.55□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W SFA1P32771 386 aa9.55□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W MGM101P32787 269 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W EMP24P32803 203 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W PXA2P34230 853 aa9.55□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W ATP3P38077 311 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W HEM14P40012 539 aa9.55□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W SDP1P40479 209 aa9.55□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W ALK1P43633 760 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W IDS2P46958 469 aa9.55□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W SPC19Q03954 165 aa9.55□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W TY1A-MR1Q04215 440 aa9.55□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W GAS2Q06135 555 aa9.55□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W PEX30Q06169 523 aa9.55□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W REX4Q08237 289 aa9.55□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W TY1A-BLQ12266 440 aa9.55□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W TRM13Q12383 476 aa9.55□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W COX9P07255 59 aa9.54□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W PUT1P09368 476 aa9.54□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W STE50P25344 346 aa9.54□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W NTH1P32356 751 aa9.54□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W ORC2P32833 620 aa9.54□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W YKL077WP36081 392 aa9.54□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W YHR097CP38809 366 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W ICE2P40499 491 aa9.54□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W PMT6P42934 759 aa9.54□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W RAD17P48581 401 aa9.54□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W TGL2P54857 326 aa9.54□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W RHO4Q00246 291 aa9.54□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W YDR541CQ03049 344 aa9.54□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W UTP15Q04305 513 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W SPR28Q04921 423 aa9.54□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W LYS21Q12122 440 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W SKS1Q12505 502 aa9.54□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W HOM3P10869 527 aa9.53□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W YMC1P32331 307 aa9.53□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W MRP20P32387 263 aa9.53□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W SAF1P38352 637 aa9.53□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W SNN1P48232 102 aa9.53□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W PEX21P50091 288 aa9.53□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W YPL113CQ02961 396 aa9.53□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W ODC1Q03028 310 aa9.53□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W TY1A-DR2Q03964 440 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W YPR127WQ06494 345 aa9.53□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W CRT10Q08226 957 aa9.53□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W ZEO1Q08245 113 aa9.53□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W TMS1Q12116 473 aa9.53□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W TY1A-DR3Q12441 440 aa9.53□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W YPR064WQ12492 139 aa9.53□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W PRM4Q12498 284 aa9.53□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W GCD1P09032 578 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 26.2 ms