RNA–Protein interactions for RNA: YHR036W

BRL1, Transcript of Essential nuclear envelope integral membrane protein, yeast

Gene BRL1, Length 1,416 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BRL1	YHR036W	NCE101	Q02820	53 aa		5.01	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	YDL086W	Q07505	273 aa		5.01	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	YDL121C	Q07541	149 aa		5.01	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	YLR053C	Q12026	108 aa		5.01	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	APC9	Q12107	265 aa		5.01	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	CTR86	P25355	563 aa		5	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	DPB3	P27344	201 aa		5	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	MRPS5	P33759	307 aa		5	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	YJR154W	P47181	346 aa		5	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	SWP1	Q02795	286 aa		5	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	NUP1	P20676	1076 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	DBF20	P32328	564 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	ACP1	P32463	125 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	YOR062C	P36025	268 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	ECM4	P36156	370 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	MRPL39	P36533	70 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	SCO2	P38072	301 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	YHL037C	P38733	133 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	NSG1	P38837	291 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	NIT2	P47016	307 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	ACS1	Q01574	713 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	YPL039W	Q03080	316 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	PLP1	Q04004	230 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	YLR036C	Q07986	203 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	CCW14	O13547	238 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	UTR1	P21373	530 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	SAN1	P22470	610 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	CLB2	P24869	491 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	YKL187C	P34231	750 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	HCS1	P34243	683 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	YJL068C	P40363	299 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	IDP2	P41939	412 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	YNR068C	P53754	272 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	YML108W	Q03759	105 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	PET122	P10355	254 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	APL3	P38065	1025 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	RIM2	P38127	377 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	SWD1	P39706	426 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	YNL195C	P40168	261 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	SYG1	P40528	902 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	YJR039W	P47107	1121 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	MAL13	P53338	473 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	URC2	Q04411	772 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	YDR124W	Q04608	324 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	RNH1	Q04740	348 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	NUR1	Q12066	484 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	DYN1	P36022	4092 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	HIS3	P06633	220 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	BAR1	P12630	587 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	KSS1	P14681	368 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	CTA1	P15202	515 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	MDH2	P22133	377 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	CLB4	P24871	460 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	EHD3	P28817	500 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	YBR220C	P38318	560 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	YEN1	P40028	759 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	PAC10	P48363	199 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	YKU80	Q04437	629 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	HFD1	Q04458	532 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	UAF30	Q08747	228 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	YDL180W	Q12301	547 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	RMP1	Q12530	201 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BRL1	YHR036W	YPR096C	O13587	100 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	PMR1	P13586	950 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	SEN2	P16658	377 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	NUP2	P32499	720 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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