RNA–Protein interactions for RNA: YDR416W

SYF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF1, Length 2,580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	YDR416W	YKL097C	P34245	136 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	KAE1	P36132	386 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	IST2	P38250	946 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	ATG7	P38862	630 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	YIL060W	P40519	144 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	YGL117W	P53133	265 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	RNT1	Q02555	471 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	YOR387C	Q08910	206 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	APC9	Q12107	265 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	YDR215C	Q12240	137 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	MRPL8	P22353	238 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	PTP1	P25044	335 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	PPZ1	P26570	692 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	PPZ2	P33329	710 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	DTR1	P38125	572 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	POP7	P38291	140 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	LAG1	P38703	411 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	HMS2	P47175	358 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	LST7	P53237	242 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	RHO4	Q00246	291 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	YPL080C	Q02826	108 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	THI7	Q05998	598 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	NDE2	Q07500	545 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	CSM4	Q08955	156 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	TPK3	P05986	398 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	COX13	P32799	129 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	HAT2	P39984	401 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	DDI1	P40087	428 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	ARG2	P40360	574 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	SNZ3	P43545	298 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	RRN9	P53437	365 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	CPR8	P53728	308 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	SNZ2	P53824	298 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	HER2	Q03557	464 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	MSS11	Q03825	758 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	RKM5	Q12367	367 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	DCC1	P25559	380 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	DEP1	P31385	405 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	SSO1	P32867	290 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	AME1	P38313	324 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	TAD2	P47058	250 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	PCP1	P53259	346 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	YPL014W	Q02606	381 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	SEC10	Q06245	871 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	ORT1	Q12375	292 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	MAK32	P23060	363 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	BUB3	P26449	341 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.78	□□□□□ -1.8	not detected
SYF1	YDR416W	RCK2	P38623	610 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	FAA2	P39518	744 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	ERV46	P39727	415 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	MIT1	P40002	666 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	YFL040W	P43562	540 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	YIP3	P53633	176 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	VAC7	P53950	1165 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	YPL077C	Q02831	240 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	VBA1	Q04301	562 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	ALE1	Q08548	619 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	YDL109C	Q12103	647 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	SET6	Q12529	373 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	APC1	P53886	1748 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SYF1	YDR416W	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	ERG4	P25340	473 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	MEI4	P29467	408 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	MRPL6	P32904	214 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	TDA11	P38854	504 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	COX15	P40086	486 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	NDC80	P40460	691 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	POG1	P40473	351 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	IDP2	P41939	412 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	TIS11	P47977	285 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	GPI1	P53306	609 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	MRS2	Q01926	470 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	ARP10	Q04549	284 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	RIM15	P43565	1770 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	NAM2	P11325	894 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	MKK1	P32490	508 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	YBR056W	P38081	501 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	YMC2	P38087	329 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	IKI1	P38874	309 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	RBG1	P39729	369 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	YER121W	P40076	114 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	PHB2	P50085	310 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	CTF19	Q02732	369 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	ASR1	Q06834	288 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	MCH4	Q08268	501 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81

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