RNA–Protein interactions for RNA: YDR069C

DOA4, Transcript of Ubiquitin hydrolase, yeast

Gene DOA4, Length 2,781 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DOA4	YDR069C	STE14	P32584	239 aa		2.97	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	SPR1	P32603	445 aa		2.97	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	UTR4	P32626	227 aa		2.97	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	FRE1	P32791	686 aa		2.97	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	YKL162C	P36052	402 aa		2.97	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	VRG4	P40107	337 aa		2.97	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	TIR3	P40552	269 aa		2.97	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	NSE4	P43124	402 aa		2.97	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	ASG7	P46993	209 aa		2.97	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	AVT4	P50944	713 aa		2.97	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	YPR078C	Q06813	372 aa		2.97	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	GUD1	Q07729	489 aa		2.97	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	YOL075C	Q08234	1294 aa		2.97	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	YLR108C	Q12259	485 aa		2.97	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	RMD5	Q12508	421 aa		2.97	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	MSS18	P08593	268 aa		2.97	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	PHO80	P20052	293 aa		2.97	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	KAR4	P25583	335 aa		2.97	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	PCL2	P25693	308 aa		2.97	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	THI80	P35202	319 aa		2.97	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	KKQ8	P36004	724 aa		2.97	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	IPT1	P38954	527 aa		2.97	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	HEM14	P40012	539 aa		2.97	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	OSW5	P40219	148 aa		2.97	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	LAS21	P40367	830 aa		2.97	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	EFM3	P47163	339 aa		2.97	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	HXT16	P47185	567 aa		2.97	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	NRK1	P53915	240 aa		2.97	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	EOS1	P53938	366 aa		2.97	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	HIM1	Q06674	414 aa		2.97	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	SRL2	Q12020	392 aa		2.97	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.97	□□□□□ -1.93	not detected
DOA4	YDR069C	LCB4	Q12246	624 aa		2.97	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	SUL2	Q12325	893 aa		2.97	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	FSH3	Q99369	266 aa		2.97	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	YLR462W	O13556	202 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	PUT2	P07275	575 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	COQ3	P27680	312 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	SSS1	P35179	80 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	COS9	P36034	407 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	LAG1	P38703	411 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	YHL049C	P38722	271 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	ARN2	P38724	620 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	YEL075C	P39972	122 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	YER189W	P40104	122 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	ELO3	P40319	345 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	ATF1	P40353	525 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	YFL064C	P43540	174 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	PMT3	P47190	753 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	NUP57	P48837	541 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	PKP2	P53170	491 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	SPC98	P53540	846 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	YPL071C	Q02864	156 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	ATG33	Q06485	197 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	FDH1	Q08911	376 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	SRO7	Q12038	1033 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	STE2	D6VTK4	431 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	UNG1	P12887	359 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	CBS2	P14905	389 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	PDX1	P16451	410 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	SNC1	P31109	117 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	SOL2	P37262	315 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	FAT1	P38225	669 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	END3	P39013	349 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	PFA3	P42836	336 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	BNA1	P47096	177 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	YJR149W	P47177	404 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	AZR1	P50080	613 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	SBH2	P52871	88 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	SLM2	P53955	656 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	ATG21	Q02887	496 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	TVP15	Q03860	143 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	ROY1	Q04847	553 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DOA4	YDR069C	RNH202	Q05635	350 aa		2.96	□□□□□ -1.94

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