RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640888.1

LIAS-222, Transcript of lipoic acid synthetase, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIAS, Length 4,041 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LIAS-222	ENST00000640888	CXCR5	P32302	372 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	CNTN2	Q02246	1040 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	MAP9	Q49MG5	647 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	ZBTB9	Q96C00	473 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	ANO9	A1A5B4	782 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	CCNE2	O96020	404 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	PPP2R5A	Q15172	486 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	SLC18A3	Q16572	532 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	PFAS	O15067	1338 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	PHACTR2	O75167	634 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	DGAT1	O75907	488 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	FTCD	O95954	541 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	SOX10	P56693	466 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	10.62	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	C12orf42	Q96LP6	360 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	PEX10	O60683	326 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	STAM2	O75886	525 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	KRT5	P13647	590 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	XKR3	Q5GH77	459 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	TREML2	Q5T2D2	321 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	ERO1B	Q86YB8	467 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	FAM212A	Q96EL1	285 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	SCLT1	Q96NL6	688 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	TSKS	Q9UJT2	592 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	SIPA1L1	O43166	1804 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	RCCD1	A6NED2	376 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	TISP43	B9A030	160 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	IRF6	O14896	467 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	TNNI1	P19237	187 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	MARK3	P27448	753 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	PTK2	Q05397	1052 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	TUBB	P07437	444 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	MOB2	Q70IA6	237 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	CCDC102A	Q96A19	550 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888		A0A087X0T9	212 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	NCK2	O43639	380 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	FAM228B	P0C875	321 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	HOXD13	P35453	343 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	NPTX2	P47972	431 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	ZNF131	P52739	623 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	NEDD9	Q14511	834 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	BRD3	Q15059	726 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	RPS6KA1	Q15418	735 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	10.6	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	TRPC6	Q9Y210	931 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	FANCG	O15287	622 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	PALM	O75781	387 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	EPHX2	P34913	555 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	WDR44	Q5JSH3	913 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	TAF3	Q5VWG9	929 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	TMEM143	Q96AN5	459 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	TBX20	Q9UMR3	447 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	ZNF185	O15231	689 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	NOL4	O94818	638 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	GGPS1	O95749	300 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	SOX5	P35711	763 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	FAM193A	P78312	1265 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LIAS-222	ENST00000640888	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		10.6	□□□□□ -0.71

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