RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635438.1

TUBBP5-204, Transcript of tubulin beta pseudogene 5, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene TUBBP5, Length 565 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBBP5-204ENST00000635438 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa25.78■■□□□ 1.72
TUBBP5-204ENST00000635438 NCK2O43639 380 aa25.77■■□□□ 1.72
TUBBP5-204ENST00000635438 FGF18O76093 207 aa25.77■■□□□ 1.72
TUBBP5-204ENST00000635438 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
TUBBP5-204ENST00000635438 CDC42EP1Q00587 391 aa25.77■■□□□ 1.72
TUBBP5-204ENST00000635438 CALCRLQ16602 461 aa25.77■■□□□ 1.72
TUBBP5-204ENST00000635438 CLLU1OSQ5K130 101 aa25.77■■□□□ 1.72
TUBBP5-204ENST00000635438 TPH2Q8IWU9 490 aa25.77■■□□□ 1.72
TUBBP5-204ENST00000635438 FAM178BQ8IXR5 827 aa25.77■■□□□ 1.72
TUBBP5-204ENST00000635438 ABI1Q8IZP0 508 aa25.77■■□□□ 1.72
TUBBP5-204ENST00000635438 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa25.77■■□□□ 1.72
TUBBP5-204ENST00000635438 SLC7A3Q8WY07 619 aa25.77■■□□□ 1.72
TUBBP5-204ENST00000635438 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
TUBBP5-204ENST00000635438 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
TUBBP5-204ENST00000635438 A0A0U1RQF3 1178 aa25.76■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 ATP2B1P20020 1258 aa25.76■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 YWHABP31946 246 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 PBX3P40426 434 aa25.76■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 LONRF3Q496Y0 759 aa25.76■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 ZNF410Q86VK4 478 aa25.76■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 C4orf19Q8IY42 314 aa25.76■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 EPHX3Q9H6B9 360 aa25.76■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 PCDHA12Q9UN75 941 aa25.76■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 NCOR1O75376 2440 aa25.76■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 HOXA2O43364 376 aa25.75■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 TBX10O75333 385 aa25.75■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 SLITRK3O94933 977 aa25.75■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 LAG3P18627 525 aa25.75■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP25.75■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 TXKP42681 527 aa25.75■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 NRIP1P48552 1158 aa25.75■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 ADAM15Q13444 863 aa25.75■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 XKR9Q5GH70 373 aa25.75■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 HELQQ8TDG4 1101 aa25.75■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa25.75■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 DACT1Q9NYF0 836 aa25.75■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa25.75■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 NEMFO60524 1076 aa25.74■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa25.74■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 ERVFC1P60507 584 aa25.74■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 OTUD6AQ7L8S5 288 aa25.74■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 CATSPER4Q7RTX7 472 aa25.74■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 PPP2R3CQ969Q6 453 aa25.74■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 IFT122Q9HBG6 1241 aa25.74■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 CHST12Q9NRB3 414 aa25.74■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 PER2O15055 1255 aa25.73■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 EOMESO95936 686 aa25.73■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 RFC5P40937 340 aa25.73■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 C8orf34Q49A92 452 aa25.73■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 KCNT2Q6UVM3 1135 aa25.73■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 GJD3Q8N144 294 aa25.73■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 LRRC43Q8N309 656 aa25.73■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 LPPQ93052 612 aa25.73■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 KIF2CQ99661 725 aa25.73■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 TLR9Q9NR96 1032 aa25.73■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa25.72■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 A0A087WWV3 80 aa25.72■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 PHKA2P46019 1235 aa25.72■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 NDUFV1P49821 464 aa25.72■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 UBE3AQ05086 875 aa25.72■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa25.72■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 EMC2Q15006 297 aa25.72■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 ZNF558Q96NG5 402 aa25.72■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 TMEM60Q9H2L4 133 aa25.72■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 TLE6Q9H808 572 aa25.72■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 MINDY3Q9H8M7 445 aa25.72■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 MCM7P33993 719 aa25.71■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP25.71■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa25.71■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 EXOC8Q8IYI6 725 aa25.71■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 EFHBQ8N7U6 833 aa25.71■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 C8orf76Q96K31 380 aa25.71■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 MTMR9Q96QG7 549 aa25.71■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 HSD17B14Q9BPX1 270 aa25.71■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 PPME1Q9Y570 386 aa25.71■■□□□ 1.71
TUBBP5-204ENST00000635438 C5orf42Q9H799 3197 aa25.7■■□□□ 1.7
TUBBP5-204ENST00000635438 MEIS3P2A8K0S8 358 aa25.7■■□□□ 1.7
TUBBP5-204ENST00000635438 RBM10P98175 930 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
TUBBP5-204ENST00000635438 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
TUBBP5-204ENST00000635438 CLEC1BQ9P126 229 aa25.7■■□□□ 1.7
TUBBP5-204ENST00000635438 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa25.7■■□□□ 1.7
TUBBP5-204ENST00000635438 CD207Q9UJ71 328 aa25.7■■□□□ 1.7
TUBBP5-204ENST00000635438 FAM50BQ9Y247 325 aa25.7■■□□□ 1.7
TUBBP5-204ENST00000635438 MBTPS2O43462 519 aa25.69■■□□□ 1.7
TUBBP5-204ENST00000635438 COL9A1P20849 921 aa25.69■■□□□ 1.7
TUBBP5-204ENST00000635438 PLCB3Q01970 1234 aa25.69■■□□□ 1.7
TUBBP5-204ENST00000635438 PLPP4Q5VZY2 271 aa25.69■■□□□ 1.7
TUBBP5-204ENST00000635438 RNF149Q8NC42 400 aa25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms