RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, human

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEMA3B-215	ENST00000621029	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		32.38	■■■□□ 2.77
SEMA3B-215	ENST00000621029	NEK9	Q8TD19	979 aa		32.38	■■■□□ 2.77
SEMA3B-215	ENST00000621029	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	32.38	■■■□□ 2.77
SEMA3B-215	ENST00000621029	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		32.38	■■■□□ 2.77
SEMA3B-215	ENST00000621029	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	32.38	■■■□□ 2.77
SEMA3B-215	ENST00000621029	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	32.38	■■■□□ 2.77
SEMA3B-215	ENST00000621029	TNFRSF10A	O00220	468 aa		32.37	■■■□□ 2.77
SEMA3B-215	ENST00000621029	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		32.37	■■■□□ 2.77
SEMA3B-215	ENST00000621029	EMC2	Q15006	297 aa		32.37	■■■□□ 2.77
SEMA3B-215	ENST00000621029	TCP11	Q8WWU5	503 aa		32.37	■■■□□ 2.77
SEMA3B-215	ENST00000621029	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		32.37	■■■□□ 2.77
SEMA3B-215	ENST00000621029	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		32.37	■■■□□ 2.77
SEMA3B-215	ENST00000621029	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	32.37	■■■□□ 2.77
SEMA3B-215	ENST00000621029	ITGB1	P05556	798 aa		32.36	■■■□□ 2.77
SEMA3B-215	ENST00000621029	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		32.36	■■■□□ 2.77
SEMA3B-215	ENST00000621029	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	32.36	■■■□□ 2.77
SEMA3B-215	ENST00000621029	CHST12	Q9NRB3	414 aa		32.36	■■■□□ 2.77
SEMA3B-215	ENST00000621029	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
SEMA3B-215	ENST00000621029	POTEM	A6NI47	508 aa		32.35	■■■□□ 2.77
SEMA3B-215	ENST00000621029	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
SEMA3B-215	ENST00000621029	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
SEMA3B-215	ENST00000621029	MTR	Q99707	1265 aa		32.35	■■■□□ 2.77
SEMA3B-215	ENST00000621029	HCST	Q9UBK5	93 aa		32.35	■■■□□ 2.77
SEMA3B-215	ENST00000621029	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	32.34	■■■□□ 2.77
SEMA3B-215	ENST00000621029		A0A0U1RQF3	1178 aa		32.34	■■■□□ 2.77
SEMA3B-215	ENST00000621029	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		32.34	■■■□□ 2.77
SEMA3B-215	ENST00000621029	TTC38	Q5R3I4	469 aa		32.34	■■■□□ 2.77
SEMA3B-215	ENST00000621029	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		32.34	■■■□□ 2.77
SEMA3B-215	ENST00000621029	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		32.34	■■■□□ 2.77
SEMA3B-215	ENST00000621029	POF1B	Q8WVV4	589 aa		32.34	■■■□□ 2.77
SEMA3B-215	ENST00000621029	KIF3A	Q9Y496	699 aa		32.34	■■■□□ 2.77
SEMA3B-215	ENST00000621029	LYPLA2	O95372	231 aa		32.33	■■■□□ 2.77
SEMA3B-215	ENST00000621029	TEC	P42680	631 aa		32.33	■■■□□ 2.77
SEMA3B-215	ENST00000621029	IGFLR1	Q9H665	355 aa		32.33	■■■□□ 2.77
SEMA3B-215	ENST00000621029	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		32.33	■■■□□ 2.77
SEMA3B-215	ENST00000621029	CLDND1	Q9NY35	253 aa		32.33	■■■□□ 2.77
SEMA3B-215	ENST00000621029	EOMES	O95936	686 aa		32.32	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	OR52Z1	P0C646	297 aa		32.32	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	DNAJB1	P25685	340 aa		32.32	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		32.32	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		32.32	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		32.32	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		32.32	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	CASD1	Q96PB1	797 aa		32.32	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		32.32	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		32.31	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029		A0A087WWV3	80 aa		32.31	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	ASAP2	O43150	1006 aa		32.31	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	LAG3	P18627	525 aa		32.31	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	32.31	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	LRRC43	Q8N309	656 aa		32.31	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	RNF149	Q8NC42	400 aa		32.31	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		32.31	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	RNF19A	Q9NV58	838 aa		32.31	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	32.3	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	NCK2	O43639	380 aa		32.3	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	SKI	P12755	728 aa		32.3	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		32.3	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		32.3	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	LONRF3	Q496Y0	759 aa		32.3	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		32.3	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	FERMT3	Q86UX7	667 aa		32.3	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	ERMN	Q8TAM6	284 aa		32.3	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	TMX3	Q96JJ7	454 aa		32.3	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	CWH43	Q9H720	699 aa		32.3	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	32.3	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	DGAT1	O75907	488 aa		32.29	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	FGF18	O76093	207 aa		32.29	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	PHKA2	P46019	1235 aa		32.29	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	TRAPPC10	P48553	1259 aa		32.29	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	CAMK1	Q14012	370 aa		32.29	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		32.29	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	32.28	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	IRS1	P35568	1242 aa		32.28	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	HYAL1	Q12794	435 aa		32.28	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	TFDP1	Q14186	410 aa		32.28	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	32.28	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	NBR1	Q14596	966 aa		32.28	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	MCTP1	Q6DN14	999 aa		32.28	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		32.28	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	32.28	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		32.28	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		32.28	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	RARRES1	P49788	294 aa		32.27	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	32.27	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		32.27	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	LPP	Q93052	612 aa		32.27	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZNF558	Q96NG5	402 aa		32.27	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		32.27	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		32.27	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		32.27	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	MYO7A	Q13402	2215 aa		32.26	■■■□□ 2.76
SEMA3B-215	ENST00000621029	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	32.26	■■■□□ 2.75
SEMA3B-215	ENST00000621029	ERLIN2	O94905	339 aa		32.26	■■■□□ 2.75
SEMA3B-215	ENST00000621029	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		32.26	■■■□□ 2.75
SEMA3B-215	ENST00000621029	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	32.26	■■■□□ 2.75
SEMA3B-215	ENST00000621029	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	32.26	■■■□□ 2.75
SEMA3B-215	ENST00000621029	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	32.26	■■■□□ 2.75
SEMA3B-215	ENST00000621029	RAB27A	P51159	221 aa		32.26	■■■□□ 2.75

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