RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 CEP89Q96ST8 783 aa24.8■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 S1PR5Q9H228 398 aa24.8■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 TMEM161AQ9NX61 479 aa24.8■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 KCNJ14Q9UNX9 436 aa24.8■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 AKT3Q9Y243 479 aa24.8■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 STBD1O95210 358 aa24.79■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 TECP42680 631 aa24.79■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 FAM189BP81408 668 aa24.79■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 INF2Q27J81 1249 aa24.79■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 FAM102BQ5T8I3 360 aa24.79■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 PLPP4Q5VZY2 271 aa24.79■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa24.79■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa24.79■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 HCSTQ9UBK5 93 aa24.79■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 SLC37A4O43826 429 aa24.78■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 GPC3P51654 580 aa24.78■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 PLCB3Q01970 1234 aa24.78■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa24.78■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 TCF25Q9BQ70 676 aa24.78■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 CWH43Q9H720 699 aa24.78■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 KCNMB3Q9NPA1 279 aa24.78■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 NR2E1Q9Y466 385 aa24.78■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 CTDNEP1O95476 244 aa24.77■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 PPM1AP35813 382 aa24.77■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 ANKRD1Q15327 319 aa24.77■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 XKR3Q5GH77 459 aa24.77■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 PPP4R3AQ6IN85 833 aa24.77■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 SYCE2Q6PIF2 218 aa24.77■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 RIPOR3Q96MK2 946 aa24.77■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa24.76■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa24.76■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 HOXA2O43364 376 aa24.76■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 FGFR1P11362 822 aa24.76■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 DARSP14868 501 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 XBP1P17861 261 aa24.76■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 AK2P54819 239 aa24.76■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 PPP2R5CQ13362 524 aa24.76■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 NEK8Q86SG6 692 aa24.76■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 LRRC43Q8N309 656 aa24.76■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 TMEM117Q9H0C3 514 aa24.76■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 VAV3Q9UKW4 847 aa24.76■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 ARID2Q68CP9 1835 aa24.76■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 MTMR3Q13615 1198 aa24.75■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 LETM2Q2VYF4 491 aa24.75■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 LLGL2Q6P1M3 1020 aa24.75■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 UBALD2Q8IYN6 164 aa24.75■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 CASP10Q92851 521 aa24.75■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 FAM20AQ96MK3 541 aa24.75■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 SORCS3Q9UPU3 1222 aa24.75■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 PROB1E7EW31 1015 aa24.74■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 SP100P23497 879 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 DRP2Q13474 957 aa24.74■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 OXER1Q8TDS5 423 aa24.74■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 ZNF558Q96NG5 402 aa24.74■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 NECTIN4Q96NY8 510 aa24.74■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 GJB4Q9NTQ9 266 aa24.74■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 RNF19AQ9NV58 838 aa24.74■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 TMEM150BA6NC51 233 aa24.73■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 HIDE1A8MVS5 230 aa24.73■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 TBX3O15119 743 aa24.73■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 PSMC5P62195 406 aa24.73■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 CDC42EP1Q00587 391 aa24.73■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 FOXK2Q01167 660 aa24.73■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 MTERF2Q49AM1 385 aa24.73■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 TPRNQ4KMQ1 711 aa24.73■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 KREMEN2Q8NCW0 462 aa24.73■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 APOL5Q9BWW9 433 aa24.73■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 H0Y858 1186 aa24.72■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 EML1O00423 815 aa24.72■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 FDPSP14324 419 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 KRT17Q04695 432 aa24.72■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 ITIH3Q06033 890 aa24.72■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 CES5AQ6NT32 575 aa24.72■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 KCNT2Q6UVM3 1135 aa24.72■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 ANO5Q75V66 913 aa24.72■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 ABI1Q8IZP0 508 aa24.72■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 WASF1Q92558 559 aa24.72■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 GTF3C6Q969F1 213 aa24.72■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.72■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 MAFO75444 373 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
SRRT-218ENST00000620394 ME3Q16798 604 aa24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms