RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 SLC26A4O43511 780 aa23.76■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 RRP9O43818 475 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 MARCH6O60337 910 aa23.76■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 CKBP12277 381 aa23.76■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 SELPP16109 830 aa23.76■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 TXKP42681 527 aa23.76■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 KRT31Q15323 416 aa23.76■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 TCP11X2Q5H9J9 407 aa23.76■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 LRCH2Q5VUJ6 765 aa23.76■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 CNNM4Q6P4Q7 775 aa23.76■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 MOXD1Q6UVY6 613 aa23.76■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 KIF18AQ8NI77 898 aa23.76■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 RIT2Q99578 217 aa23.76■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 PSMA7O14818 248 aa23.75■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 ZSCAN12O43309 604 aa23.75■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 THPOP40225 353 aa23.75■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 IGBP1P78318 339 aa23.75■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 GRB10Q13322 594 aa23.75■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 OTOP2Q7RTS6 562 aa23.75■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 SERINC5Q86VE9 423 aa23.75■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 LMBR1Q8WVP7 490 aa23.75■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 TEKT3Q9BXF9 490 aa23.75■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 THAP9Q9H5L6 903 aa23.75■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF302Q9NR11 478 aa23.75■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa23.75■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 PSAPP07602 524 aa23.74■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 RFC2P35250 354 aa23.74■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 SLC26A2P50443 739 aa23.74■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 LRRC8DQ7L1W4 858 aa23.74■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 SLC5A5Q92911 643 aa23.74■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 GJA10Q969M2 543 aa23.74■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC51Q96ER9 411 aa23.74■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa23.73■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 CHMP2AO43633 222 aa23.73■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 PFKMP08237 780 aa23.73■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 HOXC8P31273 242 aa23.73■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 GRIK4Q16099 956 aa23.73■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 PLIN2Q99541 437 aa23.73■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa23.73■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 POTEB3A0JP26 581 aa23.73■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 RRN3P2A6NIE6 340 aa23.73■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 WDR64B1ANS9 1081 aa23.73■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 KCNJ18B7U540 433 aa23.73■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 INSRRP14616 1297 aa23.73■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 COPB1P53618 953 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 KCNJ12Q14500 433 aa23.73■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 PLCB4Q15147 1175 aa23.73■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF618Q5T7W0 954 aa23.73■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 POTEBQ6S5H4 581 aa23.73■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 SV2BQ7L1I2 683 aa23.73■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 PPFIBP1Q86W92 1011 aa23.73■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 WNT8BQ93098 351 aa23.73■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 MBOAT7Q96N66 472 aa23.73■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 PNMA5Q96PV4 448 aa23.73■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 LRRC27Q9C0I9 530 aa23.73■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa23.73■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP23.73■■□□□ 1.394e-8■□□□□ 8.5
SGMS1-210ENST00000619438 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa23.72■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 PARNO95453 639 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 FECHP22830 423 aa23.72■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 TRIM14Q14142 442 aa23.72■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 PTPN21Q16825 1174 aa23.72■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 TMEM119Q4V9L6 283 aa23.72■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 TTI2Q6NXR4 508 aa23.72■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 IRF2BP1Q8IU81 584 aa23.72■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 REXO1L1PQ8IX06 675 aa23.72■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 EXOC1Q9NV70 894 aa23.72■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 ACTN1P12814 892 aa23.71■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 RBL2Q08999 1139 aa23.71■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 GOLGA8FQ08AF8 430 aa23.71■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa23.71■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 KRT79Q5XKE5 535 aa23.71■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 GABBR1Q9UBS5 961 aa23.71■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 SCN5AQ14524 2016 aa23.71■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 BICDL2A1A5D9 508 aa23.7■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 ZBBXA8MT70 800 aa23.7■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 RSPH10B2B2RC85 870 aa23.7■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 N4BP3O15049 544 aa23.7■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 PSMD10O75832 226 aa23.7■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 RSPH10BP0C881 870 aa23.7■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 SFNP31947 248 aa23.7■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 ADKP55263 362 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 ETF1P62495 437 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 ADAM17P78536 824 aa23.7■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 HYIQ5T013 277 aa23.7■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 CNGA4Q8IV77 575 aa23.7■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 HERVK_113Q902F9 699 aa23.7■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 HAS1Q92839 578 aa23.7■■□□□ 1.39
SGMS1-210ENST00000619438 UNC45AQ9H3U1 944 aa23.7■■□□□ 1.39
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