RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612839.1

CCL3L3-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3 like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCL3L3, Length 1,458 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L3-201ENST00000612839 CDC42EP1Q00587 391 aa12.59□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 PAK2Q13177 524 aa12.59□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 STK38Q15208 465 aa12.59□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 SPECC1Q5M775 1068 aa12.59□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 PADI6Q6TGC4 694 aa12.59□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 USP49Q70CQ1 688 aa12.59□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 FAM228AQ86W67 206 aa12.59□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 TCP11Q8WWU5 503 aa12.59□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 NLRP7Q8WX94 980 aa12.59□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 EPSTI1Q96J88 318 aa12.59□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 TMX1Q9H3N1 280 aa12.59□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 ERVK-5Q9HDB9 667 aa12.59□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 DNM3Q9UQ16 869 aa12.59□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa12.59□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 ARHGEF35A5YM69 484 aa12.59□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 SPTLC2O15270 562 aa12.59□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 PPP6R2O75170 966 aa12.59□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 EYA4O95677 639 aa12.59□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 DARSP14868 501 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 ARL2P36404 184 aa12.59□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa12.59□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM119Q4V9L6 283 aa12.59□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 ATL3Q6DD88 541 aa12.59□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 MAEAQ7L5Y9 396 aa12.59□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF410Q86VK4 478 aa12.59□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 KCTD17Q8N5Z5 321 aa12.59□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa12.59□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 LRRC15Q8TF66 581 aa12.59□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 NLRP4Q96MN2 994 aa12.59□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 SLC9A7Q96T83 725 aa12.59□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 PLIN2Q99541 437 aa12.59□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 CCSER1Q9C0I3 900 aa12.59□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 NT5C3AQ9H0P0 336 aa12.59□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 IFT122Q9HBG6 1241 aa12.59□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 GPRC5CQ9NQ84 441 aa12.59□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa12.59□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 TCHHQ07283 1943 aa12.58□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 CDH23Q9H251 3354 aa12.58□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 GPR182O15218 404 aa12.58□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 SLC26A4O43511 780 aa12.58□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 CYP11B2P19099 503 aa12.58□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 PBX2P40425 430 aa12.58□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 KCNJ6P48051 423 aa12.58□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 KARSQ15046 597 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 MCPH1Q8NEM0 835 aa12.58□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 ASAP3Q8TDY4 903 aa12.58□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 LINC01599Q8WXQ3 324 aa12.58□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa12.58□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 CHAMP1Q96JM3 812 aa12.58□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 SCLT1Q96NL6 688 aa12.58□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 FTHL17Q9BXU8 183 aa12.58□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 PBX4Q9BYU1 374 aa12.58□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 ENPP3O14638 875 aa12.57□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 ASAP2O43150 1006 aa12.57□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 MGEA5O60502 916 aa12.57□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa12.57□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 FGFR4P22455 802 aa12.57□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 GLRA2P23416 452 aa12.57□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 RABGGTBP53611 331 aa12.57□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 HERC6Q8IVU3 1022 aa12.57□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 MYOCDQ8IZQ8 938 aa12.57□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 RNF149Q8NC42 400 aa12.57□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 CALML4Q96GE6 196 aa12.57□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa12.57□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 CFAP45Q9UL16 551 aa12.57□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 TTC3P53804 2025 aa12.57□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 GJB5O95377 273 aa12.56□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 AMHP03971 560 aa12.56□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 PLCG1P19174 1290 aa12.56□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 DNAJB2P25686 324 aa12.56□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 SLC12A3P55017 1021 aa12.56□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 CAPSQ13938 189 aa12.56□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 ODR4Q5SWX8 454 aa12.56□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 FAM102BQ5T8I3 360 aa12.56□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 RINT1Q6NUQ1 792 aa12.56□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 C1orf186Q6ZWK4 172 aa12.56□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 KCNG4Q8TDN1 519 aa12.56□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 TOP1MTQ969P6 601 aa12.56□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 RUSC1Q9BVN2 902 aa12.56□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 MINDY3Q9H8M7 445 aa12.56□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 POLD4Q9HCU8 107 aa12.56□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
CCL3L3-201ENST00000612839 PLA2G4BP0C869 781 aa12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms