RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597360.5

PDE4C-211, Transcript of phosphodiesterase 4C, humanhuman

TSL 2

Gene PDE4C, Length 3,511 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4C-211ENST00000597360 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
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PDE4C-211ENST00000597360 CYP39A1Q9NYL5 469 aa16.6■□□□□ 0.25
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PDE4C-211ENST00000597360 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa16.6■□□□□ 0.25
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PDE4C-211ENST00000597360 DNAJC10Q8IXB1 793 aa16.58■□□□□ 0.25
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PDE4C-211ENST00000597360 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
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PDE4C-211ENST00000597360 CHMP2BQ9UQN3 213 aa16.58■□□□□ 0.24
PDE4C-211ENST00000597360 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
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PDE4C-211ENST00000597360 PEX11AO75192 247 aa16.57■□□□□ 0.24
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PDE4C-211ENST00000597360 COASYQ13057 564 aa16.57■□□□□ 0.24
PDE4C-211ENST00000597360 MAPK7Q13164 816 aa16.57■□□□□ 0.24
PDE4C-211ENST00000597360 SLC5A9Q2M3M2 681 aa16.57■□□□□ 0.24
PDE4C-211ENST00000597360 CCDC152Q4G0S7 254 aa16.57■□□□□ 0.24
PDE4C-211ENST00000597360 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
PDE4C-211ENST00000597360 USP17L1Q7RTZ2 530 aa16.57■□□□□ 0.24
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