RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa10.07□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 TCP10L2B9ZVM9 353 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 MEIS1O00470 390 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF263O14978 683 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 FLOT1O75955 427 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 CLSTN1O94985 981 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 RFX1P22670 979 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 CHRNA5P30532 468 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 CYP2C19P33261 490 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 RFC5P40937 340 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 KCNMA1Q12791 1236 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 NAB2Q15742 525 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 CFAP221Q4G0U5 840 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 ARSHQ5FYA8 562 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 C6orf118Q5T5N4 469 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 HGSNATQ68CP4 663 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM83AQ86UY5 434 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 MCF2L2Q86YR7 1114 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 SAMD3Q8N6K7 520 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 C7orf43Q8WVR3 580 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 TAF4BQ92750 862 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 VTI1AQ96AJ9 217 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 OSBPL9Q96SU4 736 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 RIT2Q99578 217 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 BHMT2Q9H2M3 363 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 MLXIPQ9HAP2 919 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 PARVGQ9HBI0 331 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 GINM1Q9NU53 330 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 PRDM4Q9UKN5 801 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 SHTN1A0MZ66 631 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 ARHGEF35A5YM69 484 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 CES2O00748 559 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 SRGAP2O75044 1071 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 NOL4O94818 638 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 CFBP00751 764 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 ASNSP08243 561 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 VIL1P09327 827 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 MYBP10242 640 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 FERP16591 822 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 TNFRSF8P28908 595 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 SNAP25P60880 206 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 TNNC1P63316 161 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 RASSF7Q02833 373 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 CYP4A11Q02928 519 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 C2orf54Q08AI8 447 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 MYBPC2Q14324 1141 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 PPP2R5AQ15172 486 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 EPHA7Q15375 998 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 CEP55Q53EZ4 464 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 C8orf74Q6P047 294 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC174Q6PII3 467 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 NIPA1Q7RTP0 329 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 NIM1KQ8IY84 436 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 SPICE1Q8N0Z3 855 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 LARGE2Q8N3Y3 721 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 MYCT1Q8N699 235 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 TTLL6Q8N841 843 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 MTMR14Q8NCE2 650 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 AGBL3Q8NEM8 1001 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 LMBR1Q8WVP7 490 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 DRC1Q96MC2 740 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF577Q9BSK1 485 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 RUSC1Q9BVN2 902 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 TIPINQ9BVW5 301 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 PDE11AQ9HCR9 933 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 ST7Q9NRC1 585 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 ASTN1O14525 1302 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A1W2PRG0 241 aa10.04□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 YDJCA8MPS7 323 aa10.04□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 OPLAHO14841 1288 aa10.04□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 PSMD10O75832 226 aa10.04□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 UCHL3P15374 230 aa10.04□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 GUCY2CP25092 1073 aa10.04□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 PRKCIP41743 596 aa10.04□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 EPHB4P54760 987 aa10.04□□□□□ -0.8
EFTUD2-222ENST00000592408 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms