RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592326.1

USP36-223, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, human

TSL 5

Gene USP36, Length 406 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP36-223	ENST00000592326	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		12.71	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		12.7	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		12.7	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	12.7	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	12.7	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	12.7	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	RPS6KB1	P23443	525 aa		12.7	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	BCAR1	P56945	870 aa		12.7	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	CDC42EP1	Q00587	391 aa		12.7	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	12.7	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	12.7	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	XKR3	Q5GH77	459 aa		12.7	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		12.7	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		12.7	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	12.7	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	TBCK	Q8TEA7	893 aa		12.7	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	12.7	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	SLC5A5	Q92911	643 aa		12.7	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	LENG9	Q96B70	501 aa		12.7	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		12.7	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	12.7	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	CHST12	Q9NRB3	414 aa		12.7	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		12.7	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		12.7	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326		A0A087WZ62	844 aa		12.69	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		12.69	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	CPLX1	O14810	134 aa		12.69	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	SKI	P12755	728 aa		12.69	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	AVPR2	P30518	371 aa		12.69	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	12.69	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	ITIH3	Q06033	890 aa		12.69	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	DRP2	Q13474	957 aa		12.69	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	KCNC3	Q14003	757 aa		12.69	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	12.69	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	VPS52	Q8N1B4	723 aa		12.69	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		12.69	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	RDM1	Q8NG50	284 aa		12.69	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	LPP	Q93052	612 aa		12.69	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		12.69	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		12.69	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		12.69	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	GBP3	Q9H0R5	595 aa		12.69	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		12.69	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	12.69	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		12.69	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	CDH22	Q9UJ99	828 aa		12.69	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	12.69	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		12.69	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	MYO7A	Q13402	2215 aa		12.69	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	TMEM150B	A6NC51	233 aa		12.68	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	WEE2	P0C1S8	567 aa		12.68	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	IFNAR1	P17181	557 aa		12.68	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	MTHFR	P42898	656 aa		12.68	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	PHKA2	P46019	1235 aa		12.68	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	MTMR3	Q13615	1198 aa		12.68	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	NTRK3	Q16288	839 aa		12.68	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326		Q4G0T1	1027 aa		12.68	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		12.68	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		12.68	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		12.68	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		12.68	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	ASIC4	Q96FT7	647 aa		12.68	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	NLRP4	Q96MN2	994 aa		12.68	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	KIF2C	Q99661	725 aa		12.68	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		12.68	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		12.68	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		12.68	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		12.68	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		12.67	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	MARCH6	O60337	910 aa		12.67	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	PSMD10	O75832	226 aa		12.67	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	TDP2	O95551	362 aa		12.67	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	TCF15	Q12870	199 aa		12.67	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	GIT2	Q14161	759 aa		12.67	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	BLID	Q8IZY5	108 aa		12.67	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	PGBD4	Q96DM1	585 aa		12.67	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	POMK	Q9H5K3	350 aa		12.67	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		12.67	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		12.67	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	NID2	Q14112	1375 aa		12.67	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	CARNS1	A5YM72	827 aa		12.66	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	EDIL3	O43854	480 aa		12.66	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	DEXI	O95424	95 aa		12.66	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
USP36-223	ENST00000592326	RAB27A	P51159	221 aa		12.66	□□□□□ -0.38

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