RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 SPTLC3Q9NUV7 552 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 TBX20Q9UMR3 447 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC169A6NNP5 214 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 CLIC2O15247 247 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 HBP1O60381 514 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 EPB41P11171 864 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 SMPD1P17405 629 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 CLCN1P35523 988 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 SOX10P56693 466 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 NOGQ13253 232 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM139Q8IV31 216 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 SIK3Q9Y2K2 1263 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 DOCK3Q8IZD9 2030 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 ZBTB42B2RXF5 422 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 PES1O00541 588 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 PPFIA4O75335 1185 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 ADKP55263 362 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 PPP2R5AQ15172 486 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 SYCP1Q15431 976 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 CYP4F22Q6NT55 531 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 APBA2Q99767 749 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 TTYH3Q9C0H2 523 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 IKZF4Q9H2S9 585 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 ERAP1Q9NZ08 941 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 CAPN11Q9UMQ6 739 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A1W2PQJ5 194 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 RASSF10A6NK89 507 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 LGALS2P05162 132 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 CASP14P31944 242 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 NAMPTP43490 491 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 GOLGA8FQ08AF8 430 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 IER5Q5VY09 327 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 TRIM50Q86XT4 487 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 AFG1LQ8WV93 481 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 FLRT1Q9NZU1 646 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 DENND3A2RUS2 1198 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 MAPK13O15264 365 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 STX10O60499 249 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 GLRA2P23416 452 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 CASP4P49662 377 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF484Q5JVG2 852 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 ASAP3Q8TDY4 903 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 TCP11Q8WWU5 503 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM143Q96AN5 459 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
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CAPNS1-207ENST00000589146 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 MGAMO43451 1857 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM186BQ8IYM0 893 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 EDEM3Q9BZQ6 932 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 SIP14410 1827 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 COL1A2P08123 1366 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 TTC26A0AVF1 554 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 MARK3P27448 753 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 CTGFP29279 349 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 TNFAIP2Q03169 654 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 KCNMA1Q12791 1236 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 CPLX3Q8WVH0 158 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 C16orf70Q9BSU1 422 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM134Q9H6X4 195 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 CREBZFQ9NS37 354 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 ARHGAP6O43182 974 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 AFPP02771 609 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 MMP3P08254 477 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 FCGRTP55899 365 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 KCNH2Q12809 1159 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 DEFB115Q30KQ5 88 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 TAS1R3Q7RTX0 852 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 OR6J1Q8NGC5 347 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC35C1Q96A29 364 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 DNAJC7Q99615 494 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 KIFC3Q9BVG8 833 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 Q9Y3F1 56 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 PIGRP01833 764 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 CYP2B6P20813 491 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 KRT9P35527 623 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 KLK7P49862 253 aa24.92■■□□□ 1.58
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