RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588345.1

CTIF-206, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-206ENST00000588345 FAM86C2PA6NEL3 165 aa20.51■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 DDX11L8A8MPP1 907 aa20.51■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.872e-6■■■■■ 54.3
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CTIF-206ENST00000588345 QARSP47897 775 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 DUSP6Q16828 381 aa20.51■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 CLLU1OSQ5K130 101 aa20.51■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 ERICH6BQ5W0A0 696 aa20.51■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 KCNT2Q6UVM3 1135 aa20.51■□□□□ 0.87
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CTIF-206ENST00000588345 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa20.51■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 WASF1Q92558 559 aa20.51■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 HAS1Q92839 578 aa20.51■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 TLE6Q9H808 572 aa20.51■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
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CTIF-206ENST00000588345 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
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CTIF-206ENST00000588345 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.871e-8■■■■□ 23.7
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CTIF-206ENST00000588345 PLA2G4FQ68DD2 849 aa20.5■□□□□ 0.87
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CTIF-206ENST00000588345 DTNBO60941 627 aa20.49■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 P4HBP07237 508 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
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CTIF-206ENST00000588345 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 RHPN2Q8IUC4 686 aa20.49■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 TNFRSF25Q93038 417 aa20.49■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
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CTIF-206ENST00000588345 SPIRE1Q08AE8 756 aa20.48■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 KCNC3Q14003 757 aa20.48■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 ME3Q16798 604 aa20.48■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa20.48■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 POTEDQ86YR6 584 aa20.48■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 C4orf19Q8IY42 314 aa20.48■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 SLC39A11Q8N1S5 342 aa20.48■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 RNF169Q8NCN4 708 aa20.48■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 VN1R2Q8NFZ6 395 aa20.48■□□□□ 0.87
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CTIF-206ENST00000588345 GTF3C6Q969F1 213 aa20.48■□□□□ 0.87
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CTIF-206ENST00000588345 KRT2P35908 639 aa20.47■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 NPEPPSP55786 919 aa20.47■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 NR5A1Q13285 461 aa20.47■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 KSR1Q8IVT5 923 aa20.47■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 EXOC8Q8IYI6 725 aa20.47■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 SLFN12Q8IYM2 578 aa20.47■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 SLC7A3Q8WY07 619 aa20.47■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 TCF25Q9BQ70 676 aa20.47■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 IFT122Q9HBG6 1241 aa20.47■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 SPG21Q9NZD8 308 aa20.47■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 C5orf42Q9H799 3197 aa20.46■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 ARID2Q68CP9 1835 aa20.46■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 FAM205CA6NFA0 338 aa20.46■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 PBX3P40426 434 aa20.46■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 RFC5P40937 340 aa20.46■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 KRT17Q04695 432 aa20.46■□□□□ 0.87
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CTIF-206ENST00000588345 NECAB1Q8N987 351 aa20.46■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 CEP170P1Q96L14 293 aa20.46■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 NLRP4Q96MN2 994 aa20.46■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 LXNQ9BS40 222 aa20.46■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa20.46■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 LOC730098B7Z3J9 87 aa20.45■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 GAS2O43903 313 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 ZNF623O75123 536 aa20.45■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 RAB27AP51159 221 aa20.45■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 RBM10P98175 930 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 CATSPER4Q7RTX7 472 aa20.45■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 BRMS1Q9HCU9 246 aa20.45■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa20.45■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 FAM105AQ9NUU6 356 aa20.45■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 HIDE1A8MVS5 230 aa20.44■□□□□ 0.86
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