RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 PRR16Q569H4 304 aa27.95■■■□□ 2.07
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CAPNS1-204ENST00000587718 LCA5LO95447 670 aa27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-204ENST00000587718 PSMC6P62333 389 aa27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-204ENST00000587718 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
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CAPNS1-204ENST00000587718 NEK9Q8TD19 979 aa27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-204ENST00000587718 SCFD2Q8WU76 684 aa27.87■■■□□ 2.05
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