RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583282.5

GGA3-216, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-216ENST00000583282 ASIC1P78348 528 aa15.52■□□□□ 0.08
GGA3-216ENST00000583282 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
GGA3-216ENST00000583282 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP15.52■□□□□ 0.08
GGA3-216ENST00000583282 TFDP1Q14186 410 aa15.52■□□□□ 0.08
GGA3-216ENST00000583282 LPIN1Q14693 890 aa15.52■□□□□ 0.08
GGA3-216ENST00000583282 LONRF3Q496Y0 759 aa15.52■□□□□ 0.08
GGA3-216ENST00000583282 FAM26DQ5JW98 314 aa15.52■□□□□ 0.08
GGA3-216ENST00000583282 FBXO47Q5MNV8 452 aa15.52■□□□□ 0.08
GGA3-216ENST00000583282 CLEC17AQ6ZS10 378 aa15.52■□□□□ 0.08
GGA3-216ENST00000583282 CNNM3Q8NE01 707 aa15.52■□□□□ 0.08
GGA3-216ENST00000583282 DDX12PQ92771 950 aa15.52■□□□□ 0.08
GGA3-216ENST00000583282 BLZF1Q9H2G9 400 aa15.52■□□□□ 0.08
GGA3-216ENST00000583282 ADAMTS10Q9H324 1103 aa15.52■□□□□ 0.08
GGA3-216ENST00000583282 MAGEF1Q9HAY2 307 aa15.52■□□□□ 0.08
GGA3-216ENST00000583282 KCND2Q9NZV8 630 aa15.52■□□□□ 0.08
GGA3-216ENST00000583282 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa15.51■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 CCDC169A6NNP5 214 aa15.51■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 GOLGA6L22H0YM25 854 aa15.51■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 NR1I2O75469 434 aa15.51■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 ZNF202O95125 648 aa15.51■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 PRR29P0C7W0 189 aa15.51■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 IDEP14735 1019 aa15.51■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 CD52P31358 61 aa15.51■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 PHKA2P46019 1235 aa15.51■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 FAM160A1Q05DH4 1040 aa15.51■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 PAK2Q13177 524 aa15.51■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 GIT2Q14161 759 aa15.51■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa15.51■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 ZNF410Q86VK4 478 aa15.51■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 FAM228AQ86W67 206 aa15.51■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 DEPTORQ8TB45 409 aa15.51■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 IFT74Q96LB3 600 aa15.51■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 TIPINQ9BVW5 301 aa15.51■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 ODF2LQ9ULJ1 636 aa15.51■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa15.5■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 K7ENM7 598 aa15.5■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 RPS6KA5O75582 802 aa15.5■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 SLFN14P0C7P3 912 aa15.5■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 DARSP14868 501 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 RFC2P35250 354 aa15.5■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 NAMPTP43490 491 aa15.5■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 EPHB4P54760 987 aa15.5■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 GPNMBQ14956 572 aa15.5■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 PPP2R5AQ15172 486 aa15.5■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 KRBA2Q6ZNG9 492 aa15.5■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 SFR1Q86XK3 245 aa15.5■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa15.5■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 PAGE5Q96GU1 130 aa15.5■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 TRIM9Q9C026 710 aa15.5■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 PARVGQ9HBI0 331 aa15.5■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 IL23AQ9NPF7 189 aa15.5■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 KBTBD4Q9NVX7 518 aa15.5■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 USP25Q9UHP3 1055 aa15.5■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa15.49■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 SLC16A4O15374 487 aa15.49■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 KINO60870 393 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 PLS3P13797 630 aa15.49■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP15.49■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 NPTX2P47972 431 aa15.49■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 AMPD3Q01432 767 aa15.49■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 CUL4BQ13620 913 aa15.49■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 TCTN1Q2MV58 587 aa15.49■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 ODR4Q5SWX8 454 aa15.49■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 MYCT1Q8N699 235 aa15.49■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 MINDY3Q9H8M7 445 aa15.49■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 IFT122Q9HBG6 1241 aa15.49■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 KMT5AQ9NQR1 393 aa15.49■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 TBC1D7Q9P0N9 293 aa15.49■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 PTPRSQ13332 1948 aa15.49■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 ZBBXA8MT70 800 aa15.48■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 ASAP2O43150 1006 aa15.48■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 ERLIN2O94905 339 aa15.48■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 PARNO95453 639 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 CXCL10P02778 98 aa15.48■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 PTENP60484 403 aa15.48■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 MBTD1Q05BQ5 628 aa15.48■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 COASYQ13057 564 aa15.48■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 OTOP2Q7RTS6 562 aa15.48■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 CATSPER4Q7RTX7 472 aa15.48■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 ENGASEQ8NFI3 743 aa15.48■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 DBF4BQ8NFT6 615 aa15.48■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 SEPT8Q92599 483 aa15.48■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 DNAJC19Q96DA6 116 aa15.48■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 VWCEQ96DN2 955 aa15.48■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
GGA3-216ENST00000583282 LRRC27Q9C0I9 530 aa15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms