RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579537.5

NFE2L1-208, Transcript of nuclear factor, erythroid 2 like 1, human

TSL 4

Gene NFE2L1, Length 372 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFE2L1-208	ENST00000579537	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	GRB10	Q13322	594 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	TFDP1	Q14186	410 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	FERMT3	Q86UX7	667 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	13.62	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	NLRP4	Q96MN2	994 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537		A0A0U1RQF3	1178 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	EOMES	O95936	686 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	PHKA2	P46019	1235 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	EPC2	Q52LR7	807 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	KRT79	Q5XKE5	535 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	TMEM192	Q8IY95	271 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	TRANK1	O15050	2925 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537		A0A087WWV3	80 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537		H3BNC9	293 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	SLC26A4	O43511	780 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	SYT1	P21579	422 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	FGFR4	P22455	802 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	ARL2	P36404	184 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	BMPR1A	P36894	532 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	PTEN	P60484	403 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	GPM6B	Q13491	265 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	POTEG	Q6S5H5	508 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	KSR1	Q8IVT5	923 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	HSCB	Q8IWL3	235 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	RNF149	Q8NC42	400 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	PLVAP	Q9BX97	442 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	DNM3	Q9UQ16	869 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	LPXN	O60711	386 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	CYP11B2	P19099	503 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	AXL	P30530	894 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	RAB27A	P51159	221 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	IL17A	Q16552	155 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	PTPRO	Q16827	1216 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	PADI6	Q6TGC4	694 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	AK8	Q96MA6	479 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	CDH23	Q9H251	3354 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NFE2L1-208	ENST00000579537	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NFE2L1-208	ENST00000579537	ZNF623	O75123	536 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NFE2L1-208	ENST00000579537	LINC00271	P0C7V0	271 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NFE2L1-208	ENST00000579537	CTNNB1	P35222	781 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NFE2L1-208	ENST00000579537	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NFE2L1-208	ENST00000579537	HYI	Q5T013	277 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NFE2L1-208	ENST00000579537	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NFE2L1-208	ENST00000579537	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NFE2L1-208	ENST00000579537	ABI1	Q8IZP0	508 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NFE2L1-208	ENST00000579537	RNF169	Q8NCN4	708 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NFE2L1-208	ENST00000579537	P2RX5	Q93086	422 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NFE2L1-208	ENST00000579537	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NFE2L1-208	ENST00000579537	CCDC51	Q96ER9	411 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NFE2L1-208	ENST00000579537	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NFE2L1-208	ENST00000579537	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NFE2L1-208	ENST00000579537	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NFE2L1-208	ENST00000579537	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NFE2L1-208	ENST00000579537	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NFE2L1-208	ENST00000579537	AAAS	Q9NRG9	546 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NFE2L1-208	ENST00000579537	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NFE2L1-208	ENST00000579537	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NFE2L1-208	ENST00000579537	CARNS1	A5YM72	827 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NFE2L1-208	ENST00000579537	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NFE2L1-208	ENST00000579537	DLL1	O00548	723 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NFE2L1-208	ENST00000579537	ERLIN2	O94905	339 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NFE2L1-208	ENST00000579537	EYA4	O95677	639 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NFE2L1-208	ENST00000579537	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NFE2L1-208	ENST00000579537	GLRA2	P23416	452 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NFE2L1-208	ENST00000579537	GATM	P50440	423 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NFE2L1-208	ENST00000579537	CAPS	Q13938	189 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NFE2L1-208	ENST00000579537	PPP2R5A	Q15172	486 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NFE2L1-208	ENST00000579537	ECM1	Q16610	540 aa		13.57	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms