RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578093.1

PTPRM-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 3

Gene PTPRM, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-206	ENST00000578093	GPR182	O15218	404 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	CSPG5	O95196	566 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	F2	P00734	622 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	SNHG28	P0DPA3	235 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	GNAT2	P19087	354 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	MAPK8	P45983	427 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	ZP2	Q05996	745 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	BFSP2	Q13515	415 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	LY6K	Q17RY6	165 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	USH1G	Q495M9	461 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	CHST3	Q7LGC8	479 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	SESTD1	Q86VW0	696 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	PRSS33	Q8NF86	280 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	ELOA3	Q8NG57	546 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	CAGE1	Q8TC20	777 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	NEK9	Q8TD19	979 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	SCFD2	Q8WU76	684 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	UIMC1	Q96RL1	719 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	RAD9A	Q99638	391 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	ALG1	Q9BT22	464 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	FSD1	Q9BTV5	496 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	NEDD4	P46934	1319 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	RAD50	Q92878	1312 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	KAT6A	Q92794	2004 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093		A0A0D9SFI3	127 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	HAS3	O00219	553 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	LINC01565	O15544	149 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	DCX	O43602	365 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	ORC4	O43929	436 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	TBX10	O75333	385 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	GH1	P01241	217 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	GHRH	P01286	108 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	CTSH	P09668	335 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	FGR	P09769	529 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	LINC00271	P0C7V0	271 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	LTBR	P36941	435 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	ADH7	P40394	386 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	HAND2	P61296	217 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	GPLD1	P80108	840 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF543	Q08ER8	600 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	DSC3	Q14574	896 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	CLUL1	Q15846	466 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	EPC2	Q52LR7	807 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	RPAIN	Q86UA6	219 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	DNER	Q8NFT8	737 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	IL31RA	Q8NI17	732 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	ACD	Q96AP0	544 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	SNX27	Q96L92	541 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	FAM227B	Q96M60	508 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	CNTN3	Q9P232	1028 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	TTC3	P53804	2025 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	CACNA1H	O95180	2353 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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