RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568829.1

SPNS1-211, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 780 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-211ENST00000568829 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
SPNS1-211ENST00000568829 GTF3C6Q969F1 213 aa18.59■□□□□ 0.57
SPNS1-211ENST00000568829 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
SPNS1-211ENST00000568829 CASD1Q96PB1 797 aa18.59■□□□□ 0.57
SPNS1-211ENST00000568829 TRAIPQ9BWF2 469 aa18.59■□□□□ 0.57
SPNS1-211ENST00000568829 EPHX3Q9H6B9 360 aa18.59■□□□□ 0.57
SPNS1-211ENST00000568829 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa18.59■□□□□ 0.57
SPNS1-211ENST00000568829 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa18.59■□□□□ 0.57
SPNS1-211ENST00000568829 MBTPS2O43462 519 aa18.58■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP18.58■□□□□ 0.565e-7■■■■■ 29.2
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SPNS1-211ENST00000568829 ANO5Q75V66 913 aa18.58■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 PGBD4Q96DM1 585 aa18.58■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 NLRP4Q96MN2 994 aa18.58■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 LXNQ9BS40 222 aa18.58■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa18.58■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 SPG21Q9NZD8 308 aa18.58■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 STK39Q9UEW8 545 aa18.58■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 VAV3Q9UKW4 847 aa18.58■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 PCDHA12Q9UN75 941 aa18.58■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 A0A087WZ62 844 aa18.57■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 EYA4O95677 639 aa18.57■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 DNAJB1P25685 340 aa18.57■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 YWHABP31946 246 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 ZP2Q05996 745 aa18.57■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 COASYQ13057 564 aa18.57■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 NCAPH2Q6IBW4 605 aa18.57■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 GLB1LQ6UWU2 654 aa18.57■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa18.57■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 TMEM87AQ8NBN3 555 aa18.57■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 CWH43Q9H720 699 aa18.57■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa18.57■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 EML1O00423 815 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 DCXO43602 365 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 TBX10O75333 385 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 STBD1O95210 358 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 IRS1P35568 1242 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 PHKA2P46019 1235 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 CLUL1Q15846 466 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 CALCRLQ16602 461 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 ME3Q16798 604 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 TMC7Q7Z402 723 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 CEP89Q96ST8 783 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 TCF25Q9BQ70 676 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 LRFN3Q9BTN0 628 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 CTDNEP1O95476 244 aa18.55■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 DRP2Q13474 957 aa18.55■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 GIT2Q14161 759 aa18.55■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 XKR9Q5GH70 373 aa18.55■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 PLA2G4FQ68DD2 849 aa18.55■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa18.55■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 POTEDQ86YR6 584 aa18.55■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 NECAB1Q8N987 351 aa18.55■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 OXER1Q8TDS5 423 aa18.55■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 HAS1Q92839 578 aa18.55■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 TMEM169Q96HH4 297 aa18.55■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 SH2D3AQ9BRG2 576 aa18.55■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 FAM105AQ9NUU6 356 aa18.55■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 MYO7AQ13402 2215 aa18.54■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 TMEM150BA6NC51 233 aa18.54■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 C19orf67A6NJJ6 358 aa18.54■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 PRR33A8MZF0 331 aa18.54■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 LINC01565O15544 149 aa18.54■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 NEMFO60524 1076 aa18.54■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF623O75123 536 aa18.54■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 FGFR4P22455 802 aa18.54■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP18.54■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 TFDP1Q14186 410 aa18.54■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 DUSP6Q16828 381 aa18.54■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 TPH2Q8IWU9 490 aa18.54■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 SMRP1Q8NCR6 262 aa18.54■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 CNNM3Q8NE01 707 aa18.54■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 URGCPQ8TCY9 931 aa18.54■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 HELQQ8TDG4 1101 aa18.54■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 MSLNLQ96KJ4 702 aa18.54■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 MTRQ99707 1265 aa18.54■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 CD320Q9NPF0 282 aa18.54■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 UBN1Q9NPG3 1134 aa18.54■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 KANSL3Q9P2N6 904 aa18.54■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 FSCN2O14926 492 aa18.53■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 ERLIN2O94905 339 aa18.53■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa18.53■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 FDPSP14324 419 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
SPNS1-211ENST00000568829 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
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