RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568530.5

PDPR-210, Transcript of pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDPR, Length 7,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPR-210ENST00000568530 JADE3Q92613 823 aa9.01□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 TJP2Q9UDY2 1190 aa9.01□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa9.01□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 LONP1P36776 959 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 SYCP2LQ5T4T6 812 aa9.01□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 KLHL24Q6TFL4 600 aa9.01□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 NLGN1Q8N2Q7 840 aa9.01□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 APOL5Q9BWW9 433 aa9.01□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 FBXO10Q9UK96 956 aa9.01□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 APPL1Q9UKG1 709 aa9.01□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 HUS1O60921 280 aa9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 CELF2O95319 508 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 DNAJB2P25686 324 aa9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 TBC1D19Q8N5T2 526 aa9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 MAGED4Q96JG8 741 aa9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 PNKPQ96T60 521 aa9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 DTNAQ9Y4J8 743 aa9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 ITIH6Q6UXX5 1313 aa9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 MED7O43513 233 aa9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 MGAT5BQ3V5L5 792 aa9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 HAUS6Q7Z4H7 955 aa9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 NEK8Q86SG6 692 aa9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 LCORLQ8N3X6 602 aa9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 TRIM58Q8NG06 486 aa9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 MAML1Q92585 1016 aa9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 CYTH2Q99418 400 aa9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 STRIP2Q9ULQ0 834 aa9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 L3MBTL1Q9Y468 752 aa9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 ERVK-10P10266 1014 aa9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 TRPC1P48995 793 aa9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 DDIASQ8IXT1 998 aa9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 AIPL1Q9NZN9 384 aa9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 RNF123Q5XPI4 1314 aa9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 LRG1P02750 347 aa9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 PSAPP07602 524 aa9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 C10orf76Q5T2E6 689 aa9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 TMTC3Q6ZXV5 915 aa9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 GIPC2Q8TF65 315 aa9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 SLAIN2Q9P270 581 aa9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 A0A087X0T9 212 aa9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 CYP7B1O75881 506 aa9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 OR1G1P47890 313 aa9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 MFAP3P55082 362 aa9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 PPP2R5BQ15173 497 aa9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 KIZQ2M2Z5 673 aa9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 FSCBQ5H9T9 825 aa9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 DNAJC24Q6P3W2 148 aa9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 ATP11CQ8NB49 1132 aa9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 DONSONQ9NYP3 566 aa9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 USE1Q9NZ43 259 aa9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa9□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 RNF40O75150 1001 aa8.99□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 MYO1DO94832 1006 aa8.99□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 YME1L1Q96TA2 773 aa8.99□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 SEL1LQ9UBV2 794 aa8.99□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa8.99□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 TMED1Q13445 227 aa8.99□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa8.99□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 SPATA33Q96N06 139 aa8.99□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 NT5C3AQ9H0P0 336 aa8.99□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 EPC1Q9H2F5 836 aa8.99□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 IKBKBO14920 756 aa8.99□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 PPP1R2P41236 205 aa8.99□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 RAD51Q06609 339 aa8.99□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 MTMR3Q13615 1198 aa8.99□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 DMC1Q14565 340 aa8.99□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 EXOC3L4Q17RC7 722 aa8.99□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 SGO1Q5FBB7 561 aa8.99□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 IL31Q6EBC2 164 aa8.99□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 SNX31Q8N9S9 440 aa8.99□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 ADGRL2O95490 1459 aa8.99□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa8.99□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 EFCAB8A8MWE9 144 aa8.99□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 C5orf58C9J3I9 102 aa8.99□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 KRT72Q14CN4 511 aa8.99□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa8.99□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 LAYNQ6UX15 382 aa8.99□□□□□ -0.97
PDPR-210ENST00000568530 CHSY1Q86X52 802 aa8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms