RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568169.5

TCF4-238, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-238	ENST00000568169	IRAK3	Q9Y616	596 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	HAX1	O00165	279 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	CDC27	P30260	824 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	CIITA	P33076	1130 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	MCTP2	Q6DN12	878 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	KANK3	Q6NY19	840 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	VPS52	Q8N1B4	723 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	TMEM169	Q96HH4	297 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	ZBP1	Q9H171	429 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	DACT1	Q9NYF0	836 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	USP34	Q70CQ2	3546 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	WDR64	B1ANS9	1081 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	OAT	P04181	439 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	CTSA	P10619	480 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	EPCAM	P16422	314 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	FGFR4	P22455	802 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	RCAN1	P53805	252 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	GIT2	Q14161	759 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	PRR16	Q569H4	304 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	LENG9	Q96B70	501 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	CHST12	Q9NRB3	414 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	SAMM50	Q9Y512	469 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	CARNS1	A5YM72	827 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	CA8	P35219	290 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	PHKA2	P46019	1235 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	PRKCE	Q02156	737 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	RNF20	Q5VTR2	975 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	IGSF21	Q96ID5	467 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	SCLT1	Q96NL6	688 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	C6orf50	Q9HD87	102 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	DISC1	Q9NRI5	854 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	EDIL3	O43854	480 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	GALT	P07902	379 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	CDC42EP1	Q00587	391 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	DRP2	Q13474	957 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	UGCG	Q16739	394 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	GPR149	Q86SP6	731 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	NLRP7	Q8WX94	980 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-238	ENST00000568169	CACNA1A	O00555	2505 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-238	ENST00000568169	MSH4	O15457	936 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF623	O75123	536 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-238	ENST00000568169	SKI	P12755	728 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-238	ENST00000568169	NPR3	P17342	541 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-238	ENST00000568169	AOC1	P19801	751 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-238	ENST00000568169	GNA11	P29992	359 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-238	ENST00000568169	SFN	P31947	248 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-238	ENST00000568169	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-238	ENST00000568169	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-238	ENST00000568169	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-238	ENST00000568169	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-238	ENST00000568169	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-238	ENST00000568169	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-238	ENST00000568169	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-238	ENST00000568169	CABP7	Q86V35	215 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-238	ENST00000568169	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-238	ENST00000568169	RASEF	Q8IZ41	740 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-238	ENST00000568169	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-238	ENST00000568169	SLC5A5	Q92911	643 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-238	ENST00000568169	LPP	Q93052	612 aa		12.83	□□□□□ -0.36

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