RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567828.1

PPP4C-212, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 3

Gene PPP4C, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-212ENST00000567828 CYP4A11Q02928 519 aa25.43■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 TRIM29Q14134 588 aa25.43■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 CLLU1OSQ5K130 101 aa25.43■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 LRRC55Q6ZSA7 311 aa25.43■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 ZNF410Q86VK4 478 aa25.43■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 THNSL1Q8IYQ7 743 aa25.43■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 CEP170P1Q96L14 293 aa25.43■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 LAG3P18627 525 aa25.42■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP25.42■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 C4orf19Q8IY42 314 aa25.42■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 ABI1Q8IZP0 508 aa25.42■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 SLC7A3Q8WY07 619 aa25.42■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 PPP2R3CQ969Q6 453 aa25.42■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 EPHX3Q9H6B9 360 aa25.42■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 DACT1Q9NYF0 836 aa25.42■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 A0A0U1RQF3 1178 aa25.41■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 YWHABP31946 246 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 PBX3P40426 434 aa25.41■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 NRIP1P48552 1158 aa25.41■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 UBE3AQ05086 875 aa25.41■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 ADAM15Q13444 863 aa25.41■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 LRRC43Q8N309 656 aa25.41■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 HELQQ8TDG4 1101 aa25.41■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 TLR9Q9NR96 1032 aa25.41■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa25.41■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 ZBTB39O15060 712 aa25.4■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 NDUFV1P49821 464 aa25.4■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 GUCY1B3Q02153 619 aa25.4■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 CALCRLQ16602 461 aa25.4■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa25.4■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 CCDC83Q8IWF9 413 aa25.4■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 GJD3Q8N144 294 aa25.4■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa25.4■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 TMEM143Q96AN5 459 aa25.4■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 FAM50BQ9Y247 325 aa25.4■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 TRIOO75962 3097 aa25.4■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 NEMFO60524 1076 aa25.39■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 RFC5P40937 340 aa25.39■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 ERVFC1P60507 584 aa25.39■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 CATSPER4Q7RTX7 472 aa25.39■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 TPH2Q8IWU9 490 aa25.39■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa25.39■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa25.39■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 IFT122Q9HBG6 1241 aa25.39■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 CHST12Q9NRB3 414 aa25.39■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 PCDHA12Q9UN75 941 aa25.39■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa25.39■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 PPME1Q9Y570 386 aa25.39■■□□□ 1.66
PPP4C-212ENST00000567828 EOMESO95936 686 aa25.38■■□□□ 1.65
PPP4C-212ENST00000567828 COL9A1P20849 921 aa25.38■■□□□ 1.65
PPP4C-212ENST00000567828 PHKA2P46019 1235 aa25.38■■□□□ 1.65
PPP4C-212ENST00000567828 EMC2Q15006 297 aa25.38■■□□□ 1.65
PPP4C-212ENST00000567828 LONRF3Q496Y0 759 aa25.38■■□□□ 1.65
PPP4C-212ENST00000567828 XKR9Q5GH70 373 aa25.38■■□□□ 1.65
PPP4C-212ENST00000567828 KCNT2Q6UVM3 1135 aa25.38■■□□□ 1.65
PPP4C-212ENST00000567828 OTUD6AQ7L8S5 288 aa25.38■■□□□ 1.65
PPP4C-212ENST00000567828 EFHBQ8N7U6 833 aa25.38■■□□□ 1.65
PPP4C-212ENST00000567828 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
PPP4C-212ENST00000567828 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
PPP4C-212ENST00000567828 ZNF558Q96NG5 402 aa25.38■■□□□ 1.65
PPP4C-212ENST00000567828 CD207Q9UJ71 328 aa25.38■■□□□ 1.65
PPP4C-212ENST00000567828 MBTPS2O43462 519 aa25.37■■□□□ 1.65
PPP4C-212ENST00000567828 SLITRK3O94933 977 aa25.37■■□□□ 1.65
PPP4C-212ENST00000567828 GLP2RO95838 553 aa25.37■■□□□ 1.65
PPP4C-212ENST00000567828 EXOC8Q8IYI6 725 aa25.37■■□□□ 1.65
PPP4C-212ENST00000567828 LPPQ93052 612 aa25.37■■□□□ 1.65
PPP4C-212ENST00000567828 TLE6Q9H808 572 aa25.37■■□□□ 1.65
PPP4C-212ENST00000567828 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
PPP4C-212ENST00000567828 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa25.37■■□□□ 1.65
PPP4C-212ENST00000567828 PER2O15055 1255 aa25.36■■□□□ 1.65
PPP4C-212ENST00000567828 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa25.36■■□□□ 1.65
PPP4C-212ENST00000567828 TXKP42681 527 aa25.36■■□□□ 1.65
PPP4C-212ENST00000567828 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa25.36■■□□□ 1.65
PPP4C-212ENST00000567828 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
PPP4C-212ENST00000567828 C8orf34Q49A92 452 aa25.36■■□□□ 1.65
PPP4C-212ENST00000567828 PLPP4Q5VZY2 271 aa25.36■■□□□ 1.65
PPP4C-212ENST00000567828 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
PPP4C-212ENST00000567828 MSLNLQ96KJ4 702 aa25.36■■□□□ 1.65
PPP4C-212ENST00000567828 TRAIPQ9BWF2 469 aa25.36■■□□□ 1.65
PPP4C-212ENST00000567828 MINDY3Q9H8M7 445 aa25.36■■□□□ 1.65
PPP4C-212ENST00000567828 CLEC1BQ9P126 229 aa25.36■■□□□ 1.65
PPP4C-212ENST00000567828 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
PPP4C-212ENST00000567828 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
PPP4C-212ENST00000567828 FSCN2O14926 492 aa25.35■■□□□ 1.65
PPP4C-212ENST00000567828 ATP2B1P20020 1258 aa25.35■■□□□ 1.65
PPP4C-212ENST00000567828 PLCB3Q01970 1234 aa25.35■■□□□ 1.65
PPP4C-212ENST00000567828 ZP2Q05996 745 aa25.35■■□□□ 1.65
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