RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566882.5

CCNDBP1-210, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 2,746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CCNDBP1-210ENST00000566882 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 UBE4BO95155 1302 aa11.07□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMCO5BA8MYB1 307 aa11.07□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa11.07□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP11.07□□□□□ -0.64
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CCNDBP1-210ENST00000566882 MYL7Q01449 175 aa11.07□□□□□ -0.64
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