RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	OCRL	Q01968	901 aa		5.86	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	VASN	Q6EMK4	673 aa		5.86	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	5.86	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	C11orf74	Q86VG3	221 aa		5.86	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	PASD1	Q8IV76	773 aa		5.86	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	HIPK4	Q8NE63	616 aa		5.86	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		5.86	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	SLC38A3	Q99624	504 aa		5.86	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		5.86	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	5.86	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		5.86	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	BTBD7	Q9P203	1132 aa		5.86	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	MCM8	Q9UJA3	840 aa		5.86	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934		A0A1W2PP64	1363 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	MSH6	P52701	1360 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF839	A8K0R7	811 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	ANP32C	O43423	234 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	BRINP1	O60477	761 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	CYP17A1	P05093	508 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	PI3	P19957	117 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	GLDC	P23378	1020 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	ITGA1	P56199	1179 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	ANAPC15	P60006	121 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	HERVK_113	P62684	666 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	IGBP1	P78318	339 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF124	Q15973	351 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	5.85	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	KCTD3	Q9Y597	815 aa		5.85	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	ATP7B	P35670	1465 aa		5.84	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		5.84	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		5.84	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		5.84	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	GPR39	O43194	453 aa		5.84	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	MED14OS	P0DP75	135 aa		5.84	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	PTGS1	P23219	599 aa		5.84	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	AOAH	P28039	575 aa		5.84	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	ADAM9	Q13443	819 aa		5.84	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	DDB1	Q16531	1140 aa		5.84	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC184	Q52MB2	194 aa		5.84	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	BROX	Q5VW32	411 aa		5.84	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		5.84	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		5.84	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	BRINP3	Q76B58	766 aa		5.84	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		5.84	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	FAM129C	Q86XR2	697 aa		5.84	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	NME9	Q86XW9	330 aa		5.84	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		5.84	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	COG1	Q8WTW3	980 aa		5.84	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	SLC5A5	Q92911	643 aa		5.84	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	C16orf92	Q96LL3	132 aa		5.84	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	ZMAT4	Q9H898	229 aa		5.84	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	VTA1	Q9NP79	307 aa		5.84	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	CROT	Q9UKG9	612 aa		5.84	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		5.84	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		5.83	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	MST1R	Q04912	1400 aa		5.83	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		5.83	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		5.83	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		5.83	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	MPIG6B	O95866	241 aa		5.83	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	LSP1	P33241	339 aa		5.83	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	FNTB	P49356	437 aa		5.83	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	RTP5	Q14D33	572 aa		5.83	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	TERF2	Q15554	542 aa		5.83	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		5.83	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		5.83	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	DTX3	Q8N9I9	347 aa		5.83	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	KY	Q8NBH2	561 aa		5.83	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		5.83	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		5.83	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	PWWP2A	Q96N64	755 aa		5.83	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		5.83	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		5.83	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	AMN	Q9BXJ7	453 aa		5.83	□□□□□ -1.48

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms