RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559586.5

RABGGTA-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 889 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-210ENST00000559586 MUC6Q6W4X9 2439 aa22.4■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 MBTPS2O43462 519 aa22.39■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 LYPLA2O95372 231 aa22.39■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa22.39■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 PDCP20941 246 aa22.39■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 TECP42680 631 aa22.39■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 CLCN3P51790 818 aa22.39■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 NPEPPSP55786 919 aa22.39■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 MTERF2Q49AM1 385 aa22.39■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 HSCBQ8IWL3 235 aa22.39■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 LRRC71Q8N4P6 559 aa22.39■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 SPPL3Q8TCT6 385 aa22.39■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa22.39■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 AAASQ9NRG9 546 aa22.39■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 C1orf112Q9NSG2 853 aa22.39■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa22.39■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 FSD2A1L4K1 749 aa22.38■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 ITGB1P05556 798 aa22.38■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 SARSP49591 514 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 NDUFV1P49821 464 aa22.38■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 DRP2Q13474 957 aa22.38■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 EFCAB12Q6NXP0 572 aa22.38■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 FERMT3Q86UX7 667 aa22.38■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 METTL13Q8N6R0 699 aa22.38■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 KLHL23Q8NBE8 558 aa22.38■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 MTMR6Q9Y217 621 aa22.38■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa22.38■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 GPR182O15218 404 aa22.37■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP22.37■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 GPR32O75388 356 aa22.37■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 MAFO75444 373 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 RPS6KA5O75582 802 aa22.37■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 VTNP04004 478 aa22.37■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 UBE3AQ05086 875 aa22.37■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa22.37■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 RESTQ13127 1097 aa22.37■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 CAMK1Q14012 370 aa22.37■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 CLUL1Q15846 466 aa22.37■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 TPH2Q8IWU9 490 aa22.37■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 EFHBQ8N7U6 833 aa22.37■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 CYP26B1Q9NR63 512 aa22.37■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 DENND3A2RUS2 1198 aa22.36■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 MED24O75448 989 aa22.36■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 YWHABP31946 246 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 IRS1P35568 1242 aa22.36■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 BRAPQ7Z569 592 aa22.36■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 CATSPER3Q86XQ3 398 aa22.36■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 IGSF22Q8N9C0 903 aa22.36■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 POF1BQ8WVV4 589 aa22.36■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 TMEM40Q8WWA1 233 aa22.36■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 ADAMTS10Q9H324 1103 aa22.36■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 LAD1O00515 517 aa22.35■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 TBX10O75333 385 aa22.35■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 EYA4O95677 639 aa22.35■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 PRPHP41219 470 aa22.35■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 SLC24A5Q71RS6 500 aa22.35■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF710Q8N1W2 664 aa22.35■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 TMX1Q9H3N1 280 aa22.35■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 ERVK-5Q9HDB9 667 aa22.35■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 RGS18Q9NS28 235 aa22.35■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 GINS2Q9Y248 185 aa22.35■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 A0A087WWV3 80 aa22.34■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.34■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 PDIA5Q14554 519 aa22.34■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 KIZQ2M2Z5 673 aa22.34■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 MSLNLQ96KJ4 702 aa22.34■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 CEP170P1Q96L14 293 aa22.34■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 MFSD14AQ96MC6 490 aa22.34■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 PPP1R16BQ96T49 567 aa22.34■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 TUFT1Q9NNX1 390 aa22.34■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 LINC01565O15544 149 aa22.33■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 CSPG5O95196 566 aa22.33■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 DNAJB1P25685 340 aa22.33■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 RPA1P27694 616 aa22.33■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 COASYQ13057 564 aa22.33■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 ECM1Q16610 540 aa22.33■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 TMEM266Q2M3C6 531 aa22.33■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 ADAM2Q99965 735 aa22.33■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 ANKEF1Q9NU02 776 aa22.33■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa22.33■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 AKT3Q9Y243 479 aa22.33■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 PPME1Q9Y570 386 aa22.33■■□□□ 1.17
RABGGTA-210ENST00000559586 PP2D1A8MPX8 630 aa22.32■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 STX6O43752 255 aa22.32■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 TMOD1P28289 359 aa22.32■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 NRIP1P48552 1158 aa22.32■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 GPC3P51654 580 aa22.32■■□□□ 1.16
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