RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559494.1

TSPAN3-207, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TSPAN3, Length 1,326 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-207ENST00000559494 RASSF8Q8NHQ8 419 aa22.52■■□□□ 1.2
TSPAN3-207ENST00000559494 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.52■■□□□ 1.2
TSPAN3-207ENST00000559494 MICAL3Q7RTP6 2002 aa22.51■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 ENPP3O14638 875 aa22.51■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 GPR182O15218 404 aa22.51■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 FGFR4P22455 802 aa22.51■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 MCM6Q14566 821 aa22.51■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 RNF149Q8NC42 400 aa22.51■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 RAD54LQ92698 747 aa22.51■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 SPATA32Q96LK8 384 aa22.51■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 GRXCR1A8MXD5 290 aa22.5■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 EFCAB14O75071 495 aa22.5■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 TXLNAP40222 546 aa22.5■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 DEFB103AP81534 67 aa22.5■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 CAPSQ13938 189 aa22.5■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 NAALADL2Q58DX5 795 aa22.5■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 ARSHQ5FYA8 562 aa22.5■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 RRAGBQ5VZM2 374 aa22.5■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 LINC01599Q8WXQ3 324 aa22.5■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 BSNDQ8WZ55 320 aa22.5■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 MINDY3Q9H8M7 445 aa22.5■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 MGEA5O60502 916 aa22.49■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 PTENP60484 403 aa22.49■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 POU5F1BQ06416 359 aa22.49■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 ODR4Q5SWX8 454 aa22.49■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa22.49■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 DAW1Q8N136 415 aa22.49■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa22.48■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 HIP1RO75146 1068 aa22.48■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 GUCY2CP25092 1073 aa22.48■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 KCNJ6P48051 423 aa22.48■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 MAPK7Q13164 816 aa22.48■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 TFDP1Q14186 410 aa22.48■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 PDILTQ8N807 584 aa22.48■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa22.48■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 KIFAP3Q92845 792 aa22.48■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 FTHL17Q9BXU8 183 aa22.48■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 GDPD2Q9HCC8 539 aa22.48■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 STK17AQ9UEE5 414 aa22.48■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 TTC3P53804 2025 aa22.47■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa22.47■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 DSC3Q14574 896 aa22.47■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 RESP18Q5W5W9 173 aa22.47■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 ADALQ6DHV7 355 aa22.47■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa22.47■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 GPBP1Q86WP2 473 aa22.47■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 SLC9A7Q96T83 725 aa22.47■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.47■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 PTPRSQ13332 1948 aa22.47■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 SFI1A8K8P3 1242 aa22.46■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 PHKA2P46019 1235 aa22.46■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 ADAM2Q99965 735 aa22.46■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 TIPINQ9BVW5 301 aa22.46■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 KCND2Q9NZV8 630 aa22.46■■□□□ 1.19
TSPAN3-207ENST00000559494 LRRIQ4A6NIV6 560 aa22.45■■□□□ 1.18
TSPAN3-207ENST00000559494 AMHP03971 560 aa22.45■■□□□ 1.18
TSPAN3-207ENST00000559494 STAT6P42226 847 aa22.45■■□□□ 1.18
TSPAN3-207ENST00000559494 RABGGTBP53611 331 aa22.45■■□□□ 1.18
TSPAN3-207ENST00000559494 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
TSPAN3-207ENST00000559494 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
TSPAN3-207ENST00000559494 CATSPER4Q7RTX7 472 aa22.45■■□□□ 1.18
TSPAN3-207ENST00000559494 HERC6Q8IVU3 1022 aa22.45■■□□□ 1.18
TSPAN3-207ENST00000559494 MYOCDQ8IZQ8 938 aa22.45■■□□□ 1.18
TSPAN3-207ENST00000559494 TOP1MTQ969P6 601 aa22.45■■□□□ 1.18
TSPAN3-207ENST00000559494 LRCH3Q96II8 777 aa22.45■■□□□ 1.18
TSPAN3-207ENST00000559494 NFKBIZQ9BYH8 718 aa22.45■■□□□ 1.18
TSPAN3-207ENST00000559494 RGS18Q9NS28 235 aa22.45■■□□□ 1.18
TSPAN3-207ENST00000559494 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP22.44■■□□□ 1.18
TSPAN3-207ENST00000559494 CMA1P23946 247 aa22.44■■□□□ 1.18
TSPAN3-207ENST00000559494 PBX2P40425 430 aa22.44■■□□□ 1.18
TSPAN3-207ENST00000559494 NAMPTP43490 491 aa22.44■■□□□ 1.18
TSPAN3-207ENST00000559494 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
TSPAN3-207ENST00000559494 E2F4Q16254 413 aa22.44■■□□□ 1.18
TSPAN3-207ENST00000559494 IFT74Q96LB3 600 aa22.44■■□□□ 1.18
TSPAN3-207ENST00000559494 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
TSPAN3-207ENST00000559494 FAM13BQ9NYF5 915 aa22.44■■□□□ 1.18
TSPAN3-207ENST00000559494 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa22.43■■□□□ 1.18
TSPAN3-207ENST00000559494 PEX3P56589 373 aa22.43■■□□□ 1.18
TSPAN3-207ENST00000559494 MBTD1Q05BQ5 628 aa22.43■■□□□ 1.18
TSPAN3-207ENST00000559494 GIT2Q14161 759 aa22.43■■□□□ 1.18
TSPAN3-207ENST00000559494 PPP2R5AQ15172 486 aa22.43■■□□□ 1.18
TSPAN3-207ENST00000559494 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
TSPAN3-207ENST00000559494 FAM117BQ6P1L5 589 aa22.43■■□□□ 1.18
TSPAN3-207ENST00000559494 SV2BQ7L1I2 683 aa22.43■■□□□ 1.18
TSPAN3-207ENST00000559494 DRC1Q96MC2 740 aa22.43■■□□□ 1.18
TSPAN3-207ENST00000559494 REEP2Q9BRK0 252 aa22.43■■□□□ 1.18
TSPAN3-207ENST00000559494 PBX4Q9BYU1 374 aa22.43■■□□□ 1.18
TSPAN3-207ENST00000559494 MYH11P35749 1972 aa22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms