RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	5.53	□□□□□ -1.52
ATXN3-238	ENST00000556288	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288		A0A1W2PQH9	124 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	WASH4P	A8MWX3	477 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288		M0R2C6	588 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	CETP	P11597	493 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	TM4SF4	P48230	202 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	PLCD1	P51178	756 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	JAG1	P78504	1218 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	PPAT	Q06203	517 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	SPP2	Q13103	211 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	SNAPC2	Q13487	334 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	APPBP2	Q92624	585 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	OSBP2	Q969R2	916 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	STAP2	Q9UGK3	403 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	LAMA4	Q16363	1823 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	GPAA1	O43292	621 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	IGSF3	O75054	1194 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	GH2	P01242	217 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	FGR	P09769	529 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	SRF	P11831	508 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	SDS	P20132	328 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	ETFB	P38117	255 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	PPIL2	Q13356	520 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	CTR9	Q6PD62	1173 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	SKAP1	Q86WV1	359 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM227B	Q96M60	508 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	FEZ1	Q99689	392 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	NAPB	Q9H115	298 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288		C9IYK1	514 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	BTBD19	C9JJ37	291 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	SMIM22	K7EJ46	135 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	PDHX	O00330	501 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	CA12	O43570	354 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	ASNS	P08243	561 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	GNAT2	P19087	354 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	HMGCS2	P54868	508 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	ZP2	Q05996	745 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	KIF22	Q14807	665 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	SEPT2	Q15019	361 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	PLCL1	Q15111	1095 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	BBS9	Q3SYG4	887 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	TTC22	Q5TAA0	569 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	C12orf60	Q5U649	245 aa		5.5	□□□□□ -1.53

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