RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555995.1

CCDC88C-210, Transcript of coiled-coil domain containing 88C, humanhuman

TSL 3

Gene CCDC88C, Length 689 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88C-210ENST00000555995 FERMT3Q86UX7 667 aa22.97■■□□□ 1.27
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CCDC88C-210ENST00000555995 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
CCDC88C-210ENST00000555995 C17orf80Q9BSJ5 609 aa22.97■■□□□ 1.27
CCDC88C-210ENST00000555995 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
CCDC88C-210ENST00000555995 MTCH2Q9Y6C9 303 aa22.97■■□□□ 1.27
CCDC88C-210ENST00000555995 C5orf67F2Z3F1 127 aa22.96■■□□□ 1.27
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CCDC88C-210ENST00000555995 CTNNB1P35222 781 aa22.96■■□□□ 1.27
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CCDC88C-210ENST00000555995 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
CCDC88C-210ENST00000555995 KRT79Q5XKE5 535 aa22.96■■□□□ 1.27
CCDC88C-210ENST00000555995 CATSPER4Q7RTX7 472 aa22.96■■□□□ 1.27
CCDC88C-210ENST00000555995 PIGOQ8TEQ8 1089 aa22.96■■□□□ 1.27
CCDC88C-210ENST00000555995 SNX21Q969T3 373 aa22.96■■□□□ 1.27
CCDC88C-210ENST00000555995 TRAIPQ9BWF2 469 aa22.96■■□□□ 1.27
CCDC88C-210ENST00000555995 PLVAPQ9BX97 442 aa22.96■■□□□ 1.27
CCDC88C-210ENST00000555995 TRANK1O15050 2925 aa22.96■■□□□ 1.27
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CCDC88C-210ENST00000555995 ZBTB39O15060 712 aa22.95■■□□□ 1.26
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CCDC88C-210ENST00000555995 NAALADL2Q58DX5 795 aa22.95■■□□□ 1.26
CCDC88C-210ENST00000555995 POTEGQ6S5H5 508 aa22.95■■□□□ 1.26
CCDC88C-210ENST00000555995 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.26
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CCDC88C-210ENST00000555995 KIAA1671Q9BY89 1806 aa22.95■■□□□ 1.26
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CCDC88C-210ENST00000555995 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa22.95■■□□□ 1.26
CCDC88C-210ENST00000555995 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
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CCDC88C-210ENST00000555995 RFXAPO00287 272 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC88C-210ENST00000555995 USO1O60763 962 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CCDC88C-210ENST00000555995 EOMESO95936 686 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC88C-210ENST00000555995 BMPR1AP36894 532 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC88C-210ENST00000555995 SPRED2Q7Z698 418 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC88C-210ENST00000555995 KSR1Q8IVT5 923 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC88C-210ENST00000555995 HSCBQ8IWL3 235 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC88C-210ENST00000555995 ABI1Q8IZP0 508 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC88C-210ENST00000555995 MICALL1Q8N3F8 863 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC88C-210ENST00000555995 RNF149Q8NC42 400 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC88C-210ENST00000555995 AAASQ9NRG9 546 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC88C-210ENST00000555995 A0A0U1RQF3 1178 aa22.93■■□□□ 1.26
CCDC88C-210ENST00000555995 LPXNO60711 386 aa22.93■■□□□ 1.26
CCDC88C-210ENST00000555995 ERLIN2O94905 339 aa22.93■■□□□ 1.26
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CCDC88C-210ENST00000555995 GPM6BQ13491 265 aa22.93■■□□□ 1.26
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CCDC88C-210ENST00000555995 P2RX5Q93086 422 aa22.93■■□□□ 1.26
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CCDC88C-210ENST00000555995 TMEM117Q9H0C3 514 aa22.93■■□□□ 1.26
CCDC88C-210ENST00000555995 LMAN2LQ9H0V9 348 aa22.93■■□□□ 1.26
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CCDC88C-210ENST00000555995 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
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CCDC88C-210ENST00000555995 TIGD5Q53EQ6 642 aa22.92■■□□□ 1.26
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CCDC88C-210ENST00000555995 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
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CCDC88C-210ENST00000555995 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa22.91■■□□□ 1.26
CCDC88C-210ENST00000555995 SLC26A4O43511 780 aa22.91■■□□□ 1.26
CCDC88C-210ENST00000555995 ARL2P36404 184 aa22.91■■□□□ 1.26
CCDC88C-210ENST00000555995 PTENP60484 403 aa22.91■■□□□ 1.26
CCDC88C-210ENST00000555995 PADI6Q6TGC4 694 aa22.91■■□□□ 1.26
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CCDC88C-210ENST00000555995 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
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CCDC88C-210ENST00000555995 DNM3Q9UQ16 869 aa22.91■■□□□ 1.26
CCDC88C-210ENST00000555995 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
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CCDC88C-210ENST00000555995 PPP2R5AQ15172 486 aa22.9■■□□□ 1.26
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CCDC88C-210ENST00000555995 LRRC43Q8N309 656 aa22.9■■□□□ 1.26
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CCDC88C-210ENST00000555995 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
CCDC88C-210ENST00000555995 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa22.9■■□□□ 1.26
CCDC88C-210ENST00000555995 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
CCDC88C-210ENST00000555995 LINC00271P0C7V0 271 aa22.89■■□□□ 1.25
CCDC88C-210ENST00000555995 LAG3P18627 525 aa22.89■■□□□ 1.25
CCDC88C-210ENST00000555995 CYP11B2P19099 503 aa22.89■■□□□ 1.25
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