RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554058.1

VASH1-AS1-201, VASH1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene VASH1-AS1, Length 871 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VASH1-AS1-201ENST00000554058 CSPG5O95196 566 aa16.82■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 CTNNB1P35222 781 aa16.82■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 ARL2P36404 184 aa16.82■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 GPM6BQ13491 265 aa16.82■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 LONRF3Q496Y0 759 aa16.82■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 RILPL1Q5EBL4 403 aa16.82■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 FAM173BQ6P4H8 233 aa16.82■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 ECHDC2Q86YB7 292 aa16.82■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 RNF149Q8NC42 400 aa16.82■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 ERMNQ8TAM6 284 aa16.82■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa16.82■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 UNC80Q8N2C7 3258 aa16.81■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 TBKBP1A7MCY6 615 aa16.81■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 H3BNC9 293 aa16.81■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 DGAT1O75907 488 aa16.81■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 SYT1P21579 422 aa16.81■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 GLRA2P23416 452 aa16.81■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 CAPSQ13938 189 aa16.81■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 CATSPER4Q7RTX7 472 aa16.81■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 RNF169Q8NCN4 708 aa16.81■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 SNX29Q8TEQ0 813 aa16.81■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 TCP11Q8WWU5 503 aa16.81■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 NACC1Q96RE7 527 aa16.81■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 TMEM161AQ9NX61 479 aa16.81■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 KIAA1024Q9UPX6 916 aa16.81■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 MEIS3P2A8K0S8 358 aa16.8■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 E9PMD0 336 aa16.8■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 GRM6O15303 877 aa16.8■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP16.8■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 BMPR1AP36894 532 aa16.8■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 CDC42EP1Q00587 391 aa16.8■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 GRIN1Q05586 938 aa16.8■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 PDIA5Q14554 519 aa16.8■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 CLLU1OSQ5K130 101 aa16.8■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 DTHD1Q6ZMT9 781 aa16.8■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 LRRC55Q6ZSA7 311 aa16.8■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 KCNK18Q7Z418 384 aa16.8■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 ZNF710Q8N1W2 664 aa16.8■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 BSNDQ8WZ55 320 aa16.8■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 LPPQ93052 612 aa16.8■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 SAMD11Q96NU1 681 aa16.8■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 CASD1Q96PB1 797 aa16.8■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa16.8■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 VWA3AA6NCI4 1184 aa16.79■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 GAS2O43903 313 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP16.79■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 PRPHP41219 470 aa16.79■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 RESTQ13127 1097 aa16.79■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 HAUS3Q68CZ6 603 aa16.79■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 PADI6Q6TGC4 694 aa16.79■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa16.79■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 EXOC8Q8IYI6 725 aa16.79■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 SNX21Q969T3 373 aa16.79■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 CPB2Q96IY4 423 aa16.79■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 PNMA5Q96PV4 448 aa16.79■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 PLIN2Q99541 437 aa16.79■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 CWH43Q9H720 699 aa16.79■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 A0A0U1RQF3 1178 aa16.78■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 ARHGEF35A5YM69 484 aa16.78■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 C5orf67F2Z3F1 127 aa16.78■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 LAD1O00515 517 aa16.78■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 ASAP2O43150 1006 aa16.78■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 DNAJB1P25685 340 aa16.78■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 PHKA2P46019 1235 aa16.78■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 PTENP60484 403 aa16.78■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 MBTD1Q05BQ5 628 aa16.78■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 UBXN11Q5T124 520 aa16.78■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 HELQQ8TDG4 1101 aa16.78■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 BHMT2Q9H2M3 363 aa16.78■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa16.78■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 MTMR6Q9Y217 621 aa16.78■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 CLIC4Q9Y696 253 aa16.78■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 TSPAN1O60635 241 aa16.77■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 EDN1P05305 212 aa16.77■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 PBX3P40426 434 aa16.77■□□□□ 0.28
VASH1-AS1-201ENST00000554058 TFF2Q03403 129 aa16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms