RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553944.2

ACTN1-AS1-201, ACTN1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene ACTN1-AS1, Length 484 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 GJB1P08034 283 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CAPN2P17655 700 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NMT1P30419 496 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NAMPTP43490 491 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NPTX2P47972 431 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NCKAP1LP55160 1127 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 IGBP1P78318 339 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 GTF2BQ00403 316 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 LRRC63Q05C16 580 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 POU5F1BQ06416 359 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TFDP1Q14186 410 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 LRRC41Q15345 812 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 BMT2Q1RMZ1 405 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SPATA1Q5VX52 437 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CENPPQ6IPU0 288 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 KLHL10Q6JEL2 608 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CXCL17Q6UXB2 119 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 HAUS6Q7Z4H7 955 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ZNF710Q8N1W2 664 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 AOPEPQ8N6M6 819 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 METTL13Q8N6R0 699 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RNF214Q8ND24 703 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 KCNN1Q92952 543 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 P2RX5Q93086 422 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 HPS3Q969F9 1004 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TMEM143Q96AN5 459 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TMEM206Q9H813 350 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 GRPEL1Q9HAV7 217 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 POLD4Q9HCU8 107 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 GPRC5CQ9NQ84 441 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SETD4Q9NVD3 440 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 EXOC7Q9UPT5 735 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FRMPD3Q5JV73 1810 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 C17orf102A2RUQ5 167 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 K7ENM7 598 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PDXKO00764 312 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CALUO43852 315 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 GLRA2P23416 452 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 GJA8P48165 433 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ACLYP53396 1101 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CHMP4BP1P59074 171 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MARCH8Q5T0T0 291 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NFRKBQ6P4R8 1299 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 LUZP1Q86V48 1076 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SESTD1Q86VW0 696 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NME8Q8N427 588 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 LINC01465Q8N7H1 131 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 GOLGA5Q8TBA6 731 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SCFD1Q8WVM8 642 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 GLT1D1Q96MS3 346 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ACCSQ96QU6 501 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FIZ1Q96SL8 496 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MAP7D2Q96T17 732 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 STRA6Q9BX79 667 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 UNC93B1Q9H1C4 597 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 C2orf40Q9H1Z8 148 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TMEM134Q9H6X4 195 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 HDAC6Q9UBN7 1215 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CTNND2Q9UQB3 1225 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 KBTBD13C9JR72 458 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 K7ERI5 159 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SLC16A4O15374 487 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PPP1R37O75864 691 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MYBP10242 640 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RPL13P26373 211 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 HOXC8P31273 242 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CASP5P51878 434 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 EFNA5P52803 228 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 STX17P56962 302 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ADAM17P78536 824 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NCAPHQ15003 741 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 EDRF1Q3B7T1 1238 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NBPF20Q3BBV1 942 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ANKRD40Q6AI12 368 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TAF2Q6P1X5 1199 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 HS2ST1Q7LGA3 356 aa9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms