RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550208.1

BRF1-216, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 3

Gene BRF1, Length 1,040 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-216ENST00000550208 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
BRF1-216ENST00000550208 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
BRF1-216ENST00000550208 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
BRF1-216ENST00000550208 EFCAB14O75071 495 aa25■■□□□ 1.59
BRF1-216ENST00000550208 ME1P48163 572 aa25■■□□□ 1.59
BRF1-216ENST00000550208 SLC12A3P55017 1021 aa25■■□□□ 1.59
BRF1-216ENST00000550208 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
BRF1-216ENST00000550208 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
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BRF1-216ENST00000550208 CAPSQ13938 189 aa24.99■■□□□ 1.59
BRF1-216ENST00000550208 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
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BRF1-216ENST00000550208 ODR4Q5SWX8 454 aa24.99■■□□□ 1.59
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BRF1-216ENST00000550208 SHC4Q6S5L8 630 aa24.99■■□□□ 1.59
BRF1-216ENST00000550208 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa24.99■■□□□ 1.59
BRF1-216ENST00000550208 LINC01599Q8WXQ3 324 aa24.99■■□□□ 1.59
BRF1-216ENST00000550208 RAD54LQ92698 747 aa24.99■■□□□ 1.59
BRF1-216ENST00000550208 A0A087X0B3 334 aa24.98■■□□□ 1.59
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BRF1-216ENST00000550208 BSNDQ8WZ55 320 aa24.98■■□□□ 1.59
BRF1-216ENST00000550208 LRCH3Q96II8 777 aa24.98■■□□□ 1.59
BRF1-216ENST00000550208 SPATA32Q96LK8 384 aa24.98■■□□□ 1.59
BRF1-216ENST00000550208 SLC9A7Q96T83 725 aa24.98■■□□□ 1.59
BRF1-216ENST00000550208 FTHL17Q9BXU8 183 aa24.98■■□□□ 1.59
BRF1-216ENST00000550208 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
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BRF1-216ENST00000550208 PTENP60484 403 aa24.97■■□□□ 1.59
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BRF1-216ENST00000550208 ARSHQ5FYA8 562 aa24.97■■□□□ 1.59
BRF1-216ENST00000550208 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa24.97■■□□□ 1.59
BRF1-216ENST00000550208 MYOCDQ8IZQ8 938 aa24.97■■□□□ 1.59
BRF1-216ENST00000550208 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
BRF1-216ENST00000550208 MICAL3Q7RTP6 2002 aa24.96■■□□□ 1.59
BRF1-216ENST00000550208 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa24.96■■□□□ 1.59
BRF1-216ENST00000550208 HIP1RO75146 1068 aa24.96■■□□□ 1.59
BRF1-216ENST00000550208 PBX2P40425 430 aa24.96■■□□□ 1.59
BRF1-216ENST00000550208 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa24.96■■□□□ 1.59
BRF1-216ENST00000550208 DSC3Q14574 896 aa24.96■■□□□ 1.59
BRF1-216ENST00000550208 NAALADL2Q58DX5 795 aa24.96■■□□□ 1.59
BRF1-216ENST00000550208 HERC6Q8IVU3 1022 aa24.96■■□□□ 1.59
BRF1-216ENST00000550208 PDILTQ8N807 584 aa24.96■■□□□ 1.59
BRF1-216ENST00000550208 ADAM2Q99965 735 aa24.96■■□□□ 1.59
BRF1-216ENST00000550208 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
BRF1-216ENST00000550208 SFI1A8K8P3 1242 aa24.95■■□□□ 1.58
BRF1-216ENST00000550208 UPP2O95045 317 aa24.95■■□□□ 1.58
BRF1-216ENST00000550208 GUCY2CP25092 1073 aa24.95■■□□□ 1.58
BRF1-216ENST00000550208 PHKA2P46019 1235 aa24.95■■□□□ 1.58
BRF1-216ENST00000550208 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP24.95■■□□□ 1.58
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BRF1-216ENST00000550208 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa24.95■■□□□ 1.58
BRF1-216ENST00000550208 CATSPER4Q7RTX7 472 aa24.95■■□□□ 1.58
BRF1-216ENST00000550208 GPBP1Q86WP2 473 aa24.95■■□□□ 1.58
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BRF1-216ENST00000550208 KIFAP3Q92845 792 aa24.95■■□□□ 1.58
BRF1-216ENST00000550208 TOP1MTQ969P6 601 aa24.95■■□□□ 1.58
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BRF1-216ENST00000550208 LRRIQ4A6NIV6 560 aa24.94■■□□□ 1.58
BRF1-216ENST00000550208 MYOGP15173 224 aa24.94■■□□□ 1.58
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BRF1-216ENST00000550208 GDPD2Q9HCC8 539 aa24.94■■□□□ 1.58
BRF1-216ENST00000550208 RGS18Q9NS28 235 aa24.94■■□□□ 1.58
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BRF1-216ENST00000550208 PTPRSQ13332 1948 aa24.93■■□□□ 1.58
BRF1-216ENST00000550208 DENND3A2RUS2 1198 aa24.93■■□□□ 1.58
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BRF1-216ENST00000550208 RESP18Q5W5W9 173 aa24.93■■□□□ 1.58
BRF1-216ENST00000550208 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
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BRF1-216ENST00000550208 TIPINQ9BVW5 301 aa24.93■■□□□ 1.58
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BRF1-216ENST00000550208 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa24.92■■□□□ 1.58
BRF1-216ENST00000550208 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
BRF1-216ENST00000550208 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
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BRF1-216ENST00000550208 ADALQ6DHV7 355 aa24.92■■□□□ 1.58
BRF1-216ENST00000550208 DRC1Q96MC2 740 aa24.92■■□□□ 1.58
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BRF1-216ENST00000550208 FAM13BQ9NYF5 915 aa24.92■■□□□ 1.58
BRF1-216ENST00000550208 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
BRF1-216ENST00000550208 C9IYK1 514 aa24.91■■□□□ 1.58
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BRF1-216ENST00000550208 NAMPTP43490 491 aa24.91■■□□□ 1.58
BRF1-216ENST00000550208 PEX3P56589 373 aa24.91■■□□□ 1.58
BRF1-216ENST00000550208 FAM189BP81408 668 aa24.91■■□□□ 1.58
BRF1-216ENST00000550208 GIT2Q14161 759 aa24.91■■□□□ 1.58
BRF1-216ENST00000550208 PPP2R5AQ15172 486 aa24.91■■□□□ 1.58
BRF1-216ENST00000550208 SV2BQ7L1I2 683 aa24.91■■□□□ 1.58
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