RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 LGR5O75473 907 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 ATG7O95352 703 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 SELPP16109 830 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 ATP2B1P20020 1258 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 MCM2P49736 904 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 STAT5BP51692 787 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP10.86□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 Q4G0T1 1027 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 ABHD15Q6UXT9 468 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 RNF135Q8IUD6 432 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 CAGE1Q8TC20 777 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 ATP6V0A1Q93050 837 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 PBXIP1Q96AQ6 731 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 THAP11Q96EK4 314 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 AZI2Q9H6S1 392 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 ERAP1Q9NZ08 941 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 SAMM50Q9Y512 469 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 MICAL3Q7RTP6 2002 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 MYO7AQ13402 2215 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 TMEM221A6NGB7 291 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 J3QL48 77 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 M0R296 226 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 GAS7O60861 476 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 NBNO60934 754 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 FECHP22830 423 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 GJB2P29033 226 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 GMPRP36959 345 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 IGBP1P78318 339 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 EPC2Q52LR7 807 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 TMCO4Q5TGY1 634 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 LRCH2Q5VUJ6 765 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 RPAINQ86UA6 219 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 EDAQ92838 391 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 SLC5A5Q92911 643 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 WNT8BQ93098 351 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 MBOAT7Q96N66 472 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 PRRX2Q99811 253 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 ZNF302Q9NR11 478 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 MARCH6O60337 910 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 PSMD10O75832 226 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 CXCL10P02778 98 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 PSAPP07602 524 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 GNAT1P11488 350 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 CKBP12277 381 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 INSRRP14616 1297 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 THPOP40225 353 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 KRT76Q01546 638 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 PPFIA1Q13136 1202 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 PTK7Q13308 1070 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 GPM6BQ13491 265 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 IKBKEQ14164 716 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 PLCB4Q15147 1175 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 FAM160B1Q5W0V3 765 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 PPP4R3AQ6IN85 833 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 PDXDC2PQ6P474 469 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 MOXD1Q6UVY6 613 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP10.84□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 NPAS3Q8IXF0 933 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 CKAP2LQ8IYA6 745 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 MYOCDQ8IZQ8 938 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 RDH13Q8NBN7 331 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 ETNPPLQ8TBG4 499 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 LMBR1Q8WVP7 490 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa10.84□□□□□ -0.67
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CS-217ENST00000550044 MRGPRX2Q96LB1 330 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 RIT2Q99578 217 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 TEKT3Q9BXF9 490 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 UNC45AQ9H3U1 944 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 DISC1Q9NRI5 854 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 GABBR1Q9UBS5 961 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 SMC3Q9UQE7 1217 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 INSL6Q9Y581 213 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 PLXNA3P51805 1871 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 EMSYQ7Z589 1322 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 NRCAMQ92823 1304 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 DCHS1Q96JQ0 3298 aa10.83□□□□□ -0.67
CS-217ENST00000550044 MBTPS2O43462 519 aa10.83□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 EFCAB14O75071 495 aa10.83□□□□□ -0.68
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