RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, human

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LMO3-222	ENST00000540445	HOXA2	O43364	376 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	COL9A1	P20849	921 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	10.08	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	DNAJB1	P25685	340 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	CYP4A11	Q02928	519 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	HYAL1	Q12794	435 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	XKR9	Q5GH70	373 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	C4orf19	Q8IY42	314 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	POF1B	Q8WVV4	589 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	TNFRSF25	Q93038	417 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	C8orf76	Q96K31	380 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	CEP89	Q96ST8	783 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	LXN	Q9BS40	222 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	CHST12	Q9NRB3	414 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	ZBTB39	O15060	712 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	NEMF	O60524	1076 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	SLITRK3	O94933	977 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	EOMES	O95936	686 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	MCM7	P33993	719 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	ZNF410	Q86VK4	478 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	TCP11	Q8WWU5	503 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	TMEM143	Q96AN5	459 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	RNF19A	Q9NV58	838 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	FAM50B	Q9Y247	325 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445		A0A0U1RQF3	1178 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	ASAP2	O43150	1006 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	TBX10	O75333	385 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	FGF18	O76093	207 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	SKI	P12755	728 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	LAG3	P18627	525 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	10.06	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	IRS1	P35568	1242 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	RFC5	P40937	340 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	KRT17	Q04695	432 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	ST3GAL1	Q11201	340 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	CLUL1	Q15846	466 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	LONRF3	Q496Y0	759 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	C8orf34	Q49A92	452 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	CASD1	Q96PB1	797 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	MTR	Q99707	1265 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	CWH43	Q9H720	699 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	TLE6	Q9H808	572 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	HCST	Q9UBK5	93 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	PPME1	Q9Y570	386 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	MYH11	P35749	1972 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445		A0A087WWV3	80 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	WNT7A	O00755	349 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	LINC01565	O15544	149 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	MBTPS2	O43462	519 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	TEC	P42680	631 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	NRIP1	P48552	1158 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	NDUFV1	P49821	464 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	UBE3A	Q05086	875 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	ADAM15	Q13444	863 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LMO3-222	ENST00000540445	EMC2	Q15006	297 aa		10.05	□□□□□ -0.8

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