RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530005.5

SLC43A3-217, Transcript of solute carrier family 43 member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SLC43A3, Length 1,434 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC43A3-217ENST00000530005 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 MINDY3Q9H8M7 445 aa21.55■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa21.55■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 RNF19AQ9NV58 838 aa21.55■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 TMEM161AQ9NX61 479 aa21.55■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 LRWD1Q9UFC0 647 aa21.55■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa21.55■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 ASAP2O43150 1006 aa21.55■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 ARL2P36404 184 aa21.55■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 HAUS3Q68CZ6 603 aa21.55■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 ASAP3Q8TDY4 903 aa21.55■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 TRAIPQ9BWF2 469 aa21.55■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 LMCD1Q9NZU5 365 aa21.55■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 LRFN2Q9ULH4 789 aa21.55■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 XIRP2A4UGR9 3374 aa21.54■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 A0A0U1RQF3 1178 aa21.54■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 H3BNC9 293 aa21.54■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa21.54■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP21.54■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 BMPR1AP36894 532 aa21.54■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 FAM102BQ5T8I3 360 aa21.54■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa21.54■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 ECHDC2Q86YB7 292 aa21.54■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 RNF149Q8NC42 400 aa21.54■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 CHST12Q9NRB3 414 aa21.54■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 KIAA1671Q9BY89 1806 aa21.53■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 VCANP13611 3396 aa21.53■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 PP2D1A8MPX8 630 aa21.53■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 USO1O60763 962 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 PDCP20941 246 aa21.53■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 SYT1P21579 422 aa21.53■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 POU5F1BQ06416 359 aa21.53■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 DTHD1Q6ZMT9 781 aa21.53■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 BRAPQ7Z569 592 aa21.53■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 PPM1EQ8WY54 764 aa21.53■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 PRDM6Q9NQX0 595 aa21.53■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 RB1P06400 928 aa21.52■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 FGFR1P11362 822 aa21.52■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 GLRA2P23416 452 aa21.52■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 PTENP60484 403 aa21.52■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 CAPSQ13938 189 aa21.52■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 RAB34Q9BZG1 259 aa21.52■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 GPRC5CQ9NQ84 441 aa21.52■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa21.52■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 DACT1Q9NYF0 836 aa21.52■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 RWDD3Q9Y3V2 267 aa21.52■■□□□ 1.04
SLC43A3-217ENST00000530005 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 CDC25AP30304 524 aa21.51■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 CTNNB1P35222 781 aa21.51■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 CATSPER4Q7RTX7 472 aa21.51■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 SNX29Q8TEQ0 813 aa21.51■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 STK24Q9Y6E0 443 aa21.51■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 TBKBP1A7MCY6 615 aa21.5■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 CYP11B2P19099 503 aa21.5■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 RESTQ13127 1097 aa21.5■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 GPM6BQ13491 265 aa21.5■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 PADI6Q6TGC4 694 aa21.5■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 MICALL1Q8N3F8 863 aa21.5■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 MCPH1Q8NEM0 835 aa21.5■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 CASD1Q96PB1 797 aa21.5■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 NFKBIZQ9BYH8 718 aa21.5■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 HCSTQ9UBK5 93 aa21.5■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 KIAA1024Q9UPX6 916 aa21.5■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 MYO7AQ13402 2215 aa21.5■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 ARHGEF35A5YM69 484 aa21.49■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 EOMESO95936 686 aa21.49■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 PHKA2P46019 1235 aa21.49■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 PLVAPQ9BX97 442 aa21.49■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 TMEM117Q9H0C3 514 aa21.49■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 FOXD4L1Q9NU39 408 aa21.49■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa21.49■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 TFDP1Q14186 410 aa21.48■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 AMHR2Q16671 573 aa21.48■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 CLLU1OSQ5K130 101 aa21.48■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 HYIQ5T013 277 aa21.48■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 KRT79Q5XKE5 535 aa21.48■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 LRRC55Q6ZSA7 311 aa21.48■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 MAEAQ7L5Y9 396 aa21.48■■□□□ 1.03
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