RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528999.5

PUF60-213, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, human

TSL 3

Gene PUF60, Length 431 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUF60-213	ENST00000528999	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PUF60-213	ENST00000528999	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PUF60-213	ENST00000528999	SAMM50	Q9Y512	469 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PUF60-213	ENST00000528999	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PUF60-213	ENST00000528999		F8VZ95	297 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999		K7ENM7	598 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	ZNF185	O15231	689 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	NR3C2	P08235	984 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	TMEM253	P0C7T8	217 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	ERCC3	P19447	782 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	VAMP7	P51809	220 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	MYL7	Q01449	175 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	MTMR2	Q13614	643 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	KIF22	Q14807	665 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	EMB	Q6PCB8	327 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	IFT20	Q8IY31	132 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	IL31RA	Q8NI17	732 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	TMC2	Q8TDI7	906 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	COG1	Q8WTW3	980 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	RNF146	Q9NTX7	359 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	PSAP	P07602	524 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	CYP2J2	P51589	502 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	ARID5A	Q03989	594 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	PPP2R5E	Q16537	467 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	ALS2CL	Q60I27	953 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	CHST13	Q8NET6	341 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	LMO3	Q8TAP4	145 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	SYT11	Q9BT88	431 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	NCAN	O14594	1321 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	CCDC188	H7C350	402 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	11.62	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	BUB1	O43683	1085 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	EVI5	O60447	810 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	DGAT1	O75907	488 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	KIF4A	O95239	1232 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	TNFAIP3	P21580	790 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	ICAM3	P32942	547 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	EPHB4	P54760	987 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	TNNC1	P63316	161 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	APBA1	Q02410	837 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	XKR9	Q5GH70	373 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	DNER	Q8NFT8	737 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	MORC4	Q8TE76	937 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	CAVIN3	Q969G5	261 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	ATG4C	Q96DT6	458 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	KLRG1	Q96E93	195 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	FBXL18	Q96ME1	805 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	ACAD9	Q9H845	621 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	STIM2	Q9P246	746 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	PPME1	Q9Y570	386 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	PFAS	O15067	1338 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	ANKRD62	A6NC57	917 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	ATP9A	O75110	1047 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	11.61	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	CCNE2	O96020	404 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	EGFR	P00533	1210 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	GZMA	P12544	262 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	GART	P22102	1010 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	CYP2C19	P33261	490 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PUF60-213	ENST00000528999	C2orf54	Q08AI8	447 aa		11.61	□□□□□ -0.55

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