RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515965.1

RNU6-377P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 377, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-377P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-377P-201ENST00000515965 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 MAN2A1Q16706 1144 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 MUM1Q2TAK8 710 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 ANO4Q32M45 955 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 TOR2AQ5JU69 321 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 LCNL1Q6ZST4 164 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 GAREM2Q75VX8 874 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 IFNL2Q8IZJ0 200 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 TSPEARQ8WU66 669 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 CHMP4CQ96CF2 233 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 WDR92Q96MX6 357 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 HIST1H2AJQ99878 128 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 TCF7L1Q9HCS4 588 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 DNAJC28Q9NX36 388 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 MKS1Q9NXB0 559 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 USP18Q9UMW8 372 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 EDARQ9UNE0 448 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 GPR45Q9Y5Y3 372 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 CDY2AQ9Y6F7 541 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 ADAMTS20P59510 1910 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 A0A1W2PR48 441 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 KLHL33A6NCF5 533 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 C2orf78A6NCI8 922 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 NRP2O60462 931 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 MT-CO1P00395 513 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 HMGCRP04035 888 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 EPHB1P54762 984 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 NFYCQ13952 458 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 ODF1Q14990 250 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 PTPN21Q16825 1174 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 ABCB5Q2M3G0 1257 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 KLHDC10Q6PID8 442 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 CLEC14AQ86T13 490 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM124AQ86V42 546 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 AMOTL1Q8IY63 956 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 AUTS2Q8WXX7 1259 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 JADE3Q92613 823 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 FATE1Q969F0 183 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 KCNC2Q96PR1 638 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 CAMKK2Q96RR4 588 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 IFT122Q9HBG6 1241 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 DPP7Q9UHL4 492 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 SCOCQ9UIL1 159 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 PTPN22Q9Y2R2 807 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZDHHC9Q9Y397 364 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 PMS2P1A4D2B8 440 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 B4GALT3O60512 393 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 ABLIM3O94929 683 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 FSBPO95073 299 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 GAAP10253 952 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP3.62□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 XPAP23025 273 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 MRE11P49959 708 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 STAT5BP51692 787 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 ADCY7P51828 1080 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC5A3P53794 718 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 HGFACQ04756 655 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 CD69Q07108 199 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 PPARAQ07869 468 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPIDRQ14159 915 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 TBR1Q16650 682 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 C19orf54Q5BKX5 351 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 NT5DC1Q5TFE4 455 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 SP8Q8IXZ3 490 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 KBTBD2Q8IY47 623 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 LPPQ93052 612 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 OR10A2Q9H208 303 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 DNAI1Q9UI46 699 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 MRFAP1Q9Y605 127 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 E2F8A0AVK6 867 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 DAPK3O43293 454 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 AKAP10O43572 662 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 B4GALT4O60513 344 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 LY86O95711 162 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 S100BP04271 92 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 BMP7P18075 431 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 CCND1P24385 295 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 WASP42768 502 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 MEOX1P50221 254 aa3.61□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms