RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513542.1

SMAD1-AS1-201, SMAD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SMAD1-AS1, Length 481 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SEPT8Q92599 483 aa14.84□□□□□ -0.03
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 IFT122Q9HBG6 1241 aa14.84□□□□□ -0.03
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ERVK-5Q9HDB9 667 aa14.84□□□□□ -0.03
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 STK17AQ9UEE5 414 aa14.84□□□□□ -0.03
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PADI3Q9ULW8 664 aa14.84□□□□□ -0.03
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SQORQ9Y6N5 450 aa14.84□□□□□ -0.03
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 HIP1RO75146 1068 aa14.83□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 RPS6KA5O75582 802 aa14.83□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ACTN1P12814 892 aa14.83□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 GUCY2CP25092 1073 aa14.83□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 E2F4Q16254 413 aa14.83□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TPRNQ4KMQ1 711 aa14.83□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ARSHQ5FYA8 562 aa14.83□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa14.83□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 USP38Q8NB14 1042 aa14.83□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 RNF149Q8NC42 400 aa14.83□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TMX1Q9H3N1 280 aa14.83□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 MINDY3Q9H8M7 445 aa14.83□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa14.83□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 A0A1W2PPC1 479 aa14.82□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 LRRIQ4A6NIV6 560 aa14.82□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 MGEA5O60502 916 aa14.82□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 BAIAP3O94812 1187 aa14.82□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 WDR5P61964 334 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 DEFB103AP81534 67 aa14.82□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ADALQ6DHV7 355 aa14.82□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ZNF710Q8N1W2 664 aa14.82□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 APBB2Q92870 758 aa14.82□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 DHX58Q96C10 678 aa14.82□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 REEP2Q9BRK0 252 aa14.82□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 KIFC3Q9BVG8 833 aa14.82□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa14.82□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 COL4A6Q14031 1691 aa14.81□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 A0A1B0GVL5 298 aa14.81□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa14.81□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ASAP2O43150 1006 aa14.81□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PFKFB1P16118 471 aa14.81□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PHKA2P46019 1235 aa14.81□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PTENP60484 403 aa14.81□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CDC42EP1Q00587 391 aa14.81□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 IKBKEQ14164 716 aa14.81□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TFDP1Q14186 410 aa14.81□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP14.81□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 KIFAP3Q92845 792 aa14.81□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa14.81□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 FAM13BQ9NYF5 915 aa14.81□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 KIAA1671Q9BY89 1806 aa14.8□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 MYMKA6NI61 221 aa14.8□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SFI1A8K8P3 1242 aa14.8□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 GRXCR1A8MXD5 290 aa14.8□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 GPR182O15218 404 aa14.8□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP14.8□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CMA1P23946 247 aa14.8□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 KCNJ6P48051 423 aa14.8□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 MBTD1Q05BQ5 628 aa14.8□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 FSIP1Q8NA03 581 aa14.8□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 STAMQ92783 540 aa14.8□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 DRC1Q96MC2 740 aa14.8□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TIPINQ9BVW5 301 aa14.8□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 KCND2Q9NZV8 630 aa14.8□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 KCNH3Q9ULD8 1083 aa14.8□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 HPSEQ9Y251 543 aa14.8□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa14.8□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 NLRC5Q86WI3 1866 aa14.8□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 A0A1W2PQ27 194 aa14.79□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 A0A1W2PQ64 194 aa14.79□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 A0A1W2PQD8 194 aa14.79□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa14.79□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 KRT18P05783 430 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 NAMPTP43490 491 aa14.79□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PEX3P56589 373 aa14.79□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 MYO9BQ13459 2157 aa14.79□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 GIT2Q14161 759 aa14.79□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 DSC3Q14574 896 aa14.79□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SV2BQ7L1I2 683 aa14.79□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CATSPER4Q7RTX7 472 aa14.79□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa14.79□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CHD9Q3L8U1 2897 aa14.78□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa14.78□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ENPP3O14638 875 aa14.78□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 B4GALT5O43286 388 aa14.78□□□□□ -0.04
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms