RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511362.5

ATXN3-211, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 3

Gene ATXN3, Length 591 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-211ENST00000511362 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa4.13□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa4.13□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 MAN2B1O00754 1011 aa4.13□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 AQP7O14520 342 aa4.13□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 CRTAMO95727 393 aa4.13□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 KCNA6P17658 529 aa4.13□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 COMTP21964 271 aa4.13□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 JAM2P57087 298 aa4.13□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 SERINC3Q13530 473 aa4.13□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 GPR19Q15760 415 aa4.13□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 IL17DQ8TAD2 202 aa4.13□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 FBXW5Q969U6 566 aa4.13□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 SIRPGQ9P1W8 387 aa4.13□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 SRPK3Q9UPE1 567 aa4.13□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa4.13□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 NINLQ9Y2I6 1382 aa4.13□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 SETD5Q9C0A6 1442 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 ERVK-7P63135 1459 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 H0Y858 1186 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 ARVCFO00192 962 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 WNT9AO14904 365 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 CHGBP05060 677 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 KRT4P19013 534 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 CSF2RBP32927 897 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 DNM2P50570 870 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 RASA3Q14644 834 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 NBPF6Q5VWK0 638 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 C16orf59Q7L2K0 433 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 AJUBAQ96IF1 538 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 NBPF4Q96M43 638 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 LRRC37BQ96QE4 947 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 LMF1Q96S06 567 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 PRRX2Q99811 253 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 TTPALQ9BTX7 342 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 PNPLA6Q8IY17 1366 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 BRWD3Q6RI45 1802 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 MROH1Q8NDA8 1641 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 ESYT3A0FGR9 886 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 CCDC66A2RUB6 948 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 MASP2O00187 686 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 ATF3P18847 181 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 ACO1P21399 889 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 GABREP78334 506 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 ST5P78524 1137 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 RBL2Q08999 1139 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 SEC23AQ15436 765 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 CRY1Q16526 586 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 EPHA10Q5JZY3 1008 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 Q6ZPA2 131 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 NLGN4XQ8N0W4 816 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 DEPDC7Q96QD5 511 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 DNAJC7Q99615 494 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 KATNBL1Q9H079 304 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 SLC52A2Q9HAB3 445 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 SMURF1Q9HCE7 757 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 SNTG2Q9NY99 539 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 NDOR1Q9UHB4 597 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 ATP23Q9Y6H3 246 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa4.11□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 RGPD1P0DJD0 1748 aa4.1□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa4.1□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa4.1□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 KIF3BO15066 747 aa4.1□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 RASGRP1O95267 797 aa4.1□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 MC4RP32245 332 aa4.1□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 ADRA1BP35368 520 aa4.1□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 FSTL4Q6MZW2 842 aa4.1□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 Q6ZSN1 163 aa4.1□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 EP400NLQ6ZTU2 488 aa4.1□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 BRINP3Q76B58 766 aa4.1□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 TICAM2Q86XR7 235 aa4.1□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 SLC7A14Q8TBB6 771 aa4.1□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 CLIP3Q96DZ5 547 aa4.1□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 PTGFRNQ9P2B2 879 aa4.1□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 COQ6Q9Y2Z9 468 aa4.1□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 CHD4Q14839 1912 aa4.1□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa4.1□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 PIK3C2BO00750 1634 aa4.1□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 PRAMEF25A6NGN4 478 aa4.09□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms