RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 FERMT3Q86UX7 667 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 TUFT1Q9NNX1 390 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKEF1Q9NU02 776 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 CSPG5O95196 566 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 STAG3L1P0CL83 205 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP20.84■□□□□ 0.93
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SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 GPRC5CQ9NQ84 441 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa20.84■□□□□ 0.93
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SH3BP2-218ENST00000511185 TBKBP1A7MCY6 615 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 DGAT1O75907 488 aa20.83■□□□□ 0.93
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SH3BP2-218ENST00000511185 CDC25AP30304 524 aa20.83■□□□□ 0.93
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SH3BP2-218ENST00000511185 RILPL1Q5EBL4 403 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF710Q8N1W2 664 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 IGSF22Q8N9C0 903 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 RNF149Q8NC42 400 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 SAMD11Q96NU1 681 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM161AQ9NX61 479 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 C5orf67F2Z3F1 127 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BP2-218ENST00000511185 H3BNC9 293 aa20.82■□□□□ 0.92
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SH3BP2-218ENST00000511185 GAS2O43903 313 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
SH3BP2-218ENST00000511185 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM189BP81408 668 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BP2-218ENST00000511185 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
SH3BP2-218ENST00000511185 GPM6BQ13491 265 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BP2-218ENST00000511185 CLLU1OSQ5K130 101 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BP2-218ENST00000511185 HAUS3Q68CZ6 603 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BP2-218ENST00000511185 MAEAQ7L5Y9 396 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BP2-218ENST00000511185 CATSPER4Q7RTX7 472 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BP2-218ENST00000511185 ECHDC2Q86YB7 292 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BP2-218ENST00000511185 RNF169Q8NCN4 708 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BP2-218ENST00000511185 ERMNQ8TAM6 284 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BP2-218ENST00000511185 SNX29Q8TEQ0 813 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BP2-218ENST00000511185 TCP11Q8WWU5 503 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BP2-218ENST00000511185 LRWD1Q9UFC0 647 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BP2-218ENST00000511185 MEIS3P2A8K0S8 358 aa20.81■□□□□ 0.92
SH3BP2-218ENST00000511185 GRM6O15303 877 aa20.81■□□□□ 0.92
SH3BP2-218ENST00000511185 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
SH3BP2-218ENST00000511185 GLRA2P23416 452 aa20.81■□□□□ 0.92
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SH3BP2-218ENST00000511185 BMPR1AP36894 532 aa20.81■□□□□ 0.92
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SH3BP2-218ENST00000511185 TFF2Q03403 129 aa20.8■□□□□ 0.92
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SH3BP2-218ENST00000511185 CASD1Q96PB1 797 aa20.8■□□□□ 0.92
SH3BP2-218ENST00000511185 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
SH3BP2-218ENST00000511185 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
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SH3BP2-218ENST00000511185 MBTD1Q05BQ5 628 aa20.79■□□□□ 0.92
SH3BP2-218ENST00000511185 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
SH3BP2-218ENST00000511185 LRRC55Q6ZSA7 311 aa20.79■□□□□ 0.92
SH3BP2-218ENST00000511185 KCNK18Q7Z418 384 aa20.79■□□□□ 0.92
SH3BP2-218ENST00000511185 HELQQ8TDG4 1101 aa20.79■□□□□ 0.92
SH3BP2-218ENST00000511185 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
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SH3BP2-218ENST00000511185 CWH43Q9H720 699 aa20.79■□□□□ 0.92
SH3BP2-218ENST00000511185 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
SH3BP2-218ENST00000511185 KIAA1024Q9UPX6 916 aa20.79■□□□□ 0.92
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A0U1RQF3 1178 aa20.78■□□□□ 0.92
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SH3BP2-218ENST00000511185 TSPAN1O60635 241 aa20.78■□□□□ 0.92
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SH3BP2-218ENST00000511185 PBX3P40426 434 aa20.78■□□□□ 0.92
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SH3BP2-218ENST00000511185 PTENP60484 403 aa20.78■□□□□ 0.92
SH3BP2-218ENST00000511185 PADI6Q6TGC4 694 aa20.78■□□□□ 0.92
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SH3BP2-218ENST00000511185 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
SH3BP2-218ENST00000511185 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
SH3BP2-218ENST00000511185 BHMT2Q9H2M3 363 aa20.78■□□□□ 0.92
SH3BP2-218ENST00000511185 POLD4Q9HCU8 107 aa20.78■□□□□ 0.92
SH3BP2-218ENST00000511185 DACT1Q9NYF0 836 aa20.78■□□□□ 0.92
SH3BP2-218ENST00000511185 RWDD3Q9Y3V2 267 aa20.78■□□□□ 0.92
SH3BP2-218ENST00000511185 ARHGEF35A5YM69 484 aa20.77■□□□□ 0.92
SH3BP2-218ENST00000511185 ITGB1P05556 798 aa20.77■□□□□ 0.92
SH3BP2-218ENST00000511185 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP20.77■□□□□ 0.92
SH3BP2-218ENST00000511185 SYT1P21579 422 aa20.77■□□□□ 0.92
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