RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507253.5

PITX1-206, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

TSL 3

Gene PITX1, Length 587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-206ENST00000507253 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 SPRED2Q7Z698 418 aa26.31■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa26.31■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 MCPH1Q8NEM0 835 aa26.31■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 ARHGEF35A5YM69 484 aa26.3■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 RFXAPO00287 272 aa26.3■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 USO1O60763 962 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa26.3■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 FGFR4P22455 802 aa26.3■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 PHKA2P46019 1235 aa26.3■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 GRB10Q13322 594 aa26.3■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 CATSPER4Q7RTX7 472 aa26.3■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 TMEM192Q8IY95 271 aa26.3■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 GDPD5Q8WTR4 605 aa26.3■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 IFT122Q9HBG6 1241 aa26.3■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 HOXA2O43364 376 aa26.29■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 FAM189BP81408 668 aa26.29■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP26.29■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 EPC2Q52LR7 807 aa26.29■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 RNF149Q8NC42 400 aa26.29■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 LMCD1Q9NZU5 365 aa26.29■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 CHD7Q9P2D1 2997 aa26.28■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 SYT1P21579 422 aa26.28■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 CTNNB1P35222 781 aa26.28■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 POU5F1BQ06416 359 aa26.28■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 MTCH2Q9Y6C9 303 aa26.28■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 RB1P06400 928 aa26.27■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 SKIP12755 728 aa26.27■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 ARL2P36404 184 aa26.27■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 SLC17A8Q8NDX2 589 aa26.27■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 FOXD4L1Q9NU39 408 aa26.27■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 KIAA1024Q9UPX6 916 aa26.27■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 COL6A3P12111 3177 aa26.27■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 A0A087WWV3 80 aa26.26■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 A0A0U1RQF3 1178 aa26.26■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 LPXNO60711 386 aa26.26■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 IL17AQ16552 155 aa26.26■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 PADI6Q6TGC4 694 aa26.26■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 ECHDC2Q86YB7 292 aa26.26■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 MICALL1Q8N3F8 863 aa26.26■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 PPM1EQ8WY54 764 aa26.26■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 TRAIPQ9BWF2 469 aa26.26■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa26.26■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 VWA3AA6NCI4 1184 aa26.25■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 C5orf67F2Z3F1 127 aa26.25■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 ERLIN2O94905 339 aa26.25■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 EOMESO95936 686 aa26.25■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 BMPR1AP36894 532 aa26.25■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 RAB27AP51159 221 aa26.25■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 PTENP60484 403 aa26.25■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 PTPROQ16827 1216 aa26.25■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 ABI1Q8IZP0 508 aa26.25■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 KCTD17Q8N5Z5 321 aa26.25■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 ASAP3Q8TDY4 903 aa26.25■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 AK8Q96MA6 479 aa26.25■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 PLVAPQ9BX97 442 aa26.25■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 NFKBIZQ9BYH8 718 aa26.25■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 DNM3Q9UQ16 869 aa26.25■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 KIAA1671Q9BY89 1806 aa26.25■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 TBKBP1A7MCY6 615 aa26.24■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 H3BNC9 293 aa26.24■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 CYP11B2P19099 503 aa26.24■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 GPM6BQ13491 265 aa26.24■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 CAPSQ13938 189 aa26.24■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 RSPH1Q8WYR4 309 aa26.24■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 TMEM117Q9H0C3 514 aa26.24■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 NT5C3AQ9H0P0 336 aa26.24■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 BHMT2Q9H2M3 363 aa26.24■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 PP2D1A8MPX8 630 aa26.23■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 STX6O43752 255 aa26.23■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 GLRA2P23416 452 aa26.23■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 GATMP50440 423 aa26.23■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 ECM1Q16610 540 aa26.23■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 FAM102BQ5T8I3 360 aa26.23■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 MAEAQ7L5Y9 396 aa26.23■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 AAASQ9NRG9 546 aa26.23■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa26.22■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 SLC26A4O43511 780 aa26.22■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 EYA4O95677 639 aa26.22■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 LINC00271P0C7V0 271 aa26.22■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 FGFR1P11362 822 aa26.22■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 AXLP30530 894 aa26.22■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 RESTQ13127 1097 aa26.22■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
PITX1-206ENST00000507253 NAALADL2Q58DX5 795 aa26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 140.6 ms