RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504971.1

FBXO38-208, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 3

Gene FBXO38, Length 492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-208	ENST00000504971	ZBTB16	Q05516	673 aa		7.4	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	CLN3	Q13286	438 aa		7.4	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	ELF2	Q15723	593 aa		7.4	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC14A2	Q15849	920 aa		7.4	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		7.4	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		7.4	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	KDELC1	Q6UW63	502 aa		7.4	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		7.4	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		7.4	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		7.4	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	PODN	Q7Z5L7	613 aa		7.4	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	7.4	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		7.4	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	FBXL16	Q8N461	479 aa		7.4	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	7.4	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	C7orf31	Q8N865	590 aa		7.4	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	SPERT	Q8NA61	448 aa		7.4	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		7.4	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	C1orf74	Q96LT6	269 aa		7.4	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	PPM1M	Q96MI6	270 aa		7.4	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		7.4	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		7.4	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	STK39	Q9UEW8	545 aa		7.4	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	GGA1	Q9UJY5	639 aa		7.4	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		7.4	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		7.4	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		7.4	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	CACNA1S	Q13698	1873 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	GAK	O14976	1311 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	ESYT3	A0FGR9	886 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	ANO9	A1A5B4	782 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971		H0YIN7	160 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	FOXP2	O15409	715 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	OIP5	O43482	229 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	C21orf2	O43822	256 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	OFD1	O75665	1012 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	APBB3	O95704	486 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	CHGB	P05060	677 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	THBS1	P07996	1170 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	FBXO45	P0C2W1	286 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	PEX5	P50542	639 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	HECTD3	Q5T447	861 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	RNF135	Q8IUD6	432 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	PJA1	Q8NG27	643 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	MGARP	Q8TDB4	240 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	CDKL2	Q92772	493 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	CNKSR1	Q969H4	720 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	TMX3	Q96JJ7	454 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	COG8	Q96MW5	612 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	MTRR	Q9UBK8	725 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		7.38	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		7.38	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM196B	A6NMK8	535 aa		7.38	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	AKAP10	O43572	662 aa		7.38	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	NMT2	O60551	498 aa		7.38	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	ADAMTS4	O75173	837 aa		7.38	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	7.38	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	HOXD12	P35452	270 aa		7.38	□□□□□ -1.23

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