RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502974.1

CXCL3-202, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

TSL 2

Gene CXCL3, Length 630 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-202ENST00000502974 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 VWA3AA6NCI4 1184 aa27.8■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 DGKIO75912 1065 aa27.8■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 MUTP22033 750 aa27.8■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 SARSP49591 514 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 ECM1Q16610 540 aa27.8■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 EPC2Q52LR7 807 aa27.8■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 KRT79Q5XKE5 535 aa27.8■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 LPXNO60711 386 aa27.79■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 CDC25AP30304 524 aa27.79■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa27.79■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa27.79■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 RGS18Q9NS28 235 aa27.79■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 KIAA1024Q9UPX6 916 aa27.79■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa27.79■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 A0A0C4DFX4 3053 aa27.78■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 BMP15O95972 392 aa27.78■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa27.78■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 FAM173BQ6P4H8 233 aa27.78■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 SLC24A5Q71RS6 500 aa27.78■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 TMEM192Q8IY95 271 aa27.78■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 RWDD3Q9Y3V2 267 aa27.78■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 ARHGEF35A5YM69 484 aa27.77■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 CTNNB1P35222 781 aa27.77■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 LMCD1Q9NZU5 365 aa27.77■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 ASAP2O43150 1006 aa27.76■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP27.76■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 DSC3Q14574 896 aa27.76■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 MAEAQ7L5Y9 396 aa27.76■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 CRIPAKQ8N1N5 446 aa27.76■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 IFT122Q9HBG6 1241 aa27.76■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 PRDM6Q9NQX0 595 aa27.76■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 CLIC4Q9Y696 253 aa27.76■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 C9IYK1 514 aa27.75■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 PADI6Q6TGC4 694 aa27.75■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 RNF149Q8NC42 400 aa27.75■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 ASAP3Q8TDY4 903 aa27.75■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 THEGQ9P2T0 379 aa27.75■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 MYH15Q9Y2K3 1946 aa27.75■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 ARL2P36404 184 aa27.74■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 GPM6BQ13491 265 aa27.74■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 PTPROQ16827 1216 aa27.74■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 CATSPER4Q7RTX7 472 aa27.74■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 MCPH1Q8NEM0 835 aa27.74■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 BHMT2Q9H2M3 363 aa27.74■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 GPRC5CQ9NQ84 441 aa27.74■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 H3BNC9 293 aa27.73■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 TFDP1Q14186 410 aa27.73■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa27.73■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 DNM3Q9UQ16 869 aa27.73■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 E9PMD0 336 aa27.72■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 BMPR1AP36894 532 aa27.72■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 PHKA2P46019 1235 aa27.72■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 CAPSQ13938 189 aa27.72■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 FAM102BQ5T8I3 360 aa27.72■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 MINDY3Q9H8M7 445 aa27.72■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 TMEM161AQ9NX61 479 aa27.72■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 EYA4O95677 639 aa27.71■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 RB1P06400 928 aa27.71■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 CYP11B2P19099 503 aa27.71■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 GLRA2P23416 452 aa27.71■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 GATMP50440 423 aa27.71■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 PTPAQ15257 358 aa27.71■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa27.71■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 AK8Q96MA6 479 aa27.71■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 PLIN2Q99541 437 aa27.71■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 DACT1Q9NYF0 836 aa27.71■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 KIAA1671Q9BY89 1806 aa27.71■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 REV3LO60673 3130 aa27.7■■■□□ 2.03
CXCL3-202ENST00000502974 TBKBP1A7MCY6 615 aa27.7■■■□□ 2.02
CXCL3-202ENST00000502974 C5orf67F2Z3F1 127 aa27.7■■■□□ 2.02
CXCL3-202ENST00000502974 FAM189BP81408 668 aa27.7■■■□□ 2.02
CXCL3-202ENST00000502974 GRIN1Q05586 938 aa27.7■■■□□ 2.02
CXCL3-202ENST00000502974 KCNK18Q7Z418 384 aa27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms